RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	MRX3	P38172	270 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	HUA1	P40325	198 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YIL001W	P40560	513 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	FAR8	Q05040	523 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	COQ10	Q08058	207 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	JEN1	P36035	616 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	FIS1	P40515	155 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YJR079W	P47126	109 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	TOS8	P53147	276 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YBR096W	P38256	230 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	DDI1	P40087	428 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	SNZ2	P53824	298 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YLR413W	Q06689	675 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	SNA3	P14359	133 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	FZO1	P38297	855 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YOR186W	Q08560	144 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YPL257W	Q08974	193 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	MRPL40	P36534	297 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	SVP26	P38869	228 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	GMC2	Q06201	188 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	MSA1	Q08471	629 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	AQY2	P0CD90	149 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	VPS3	P23643	1011 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	GOS1	P38736	223 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	ATG17	Q06410	417 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
YKL063C	YKL063C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	TIR3	P40552	269 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	BOL2	P53082	120 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	UBC7	Q02159	165 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	SPG4	Q04438	115 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	SNF8	Q12483	233 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	FZF1	P32805	299 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YAR068W	P39564	161 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	RPA43	P46669	326 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YPL229W	Q99395	206 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	MSB2	P32334	1306 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	SGE1	P33335	543 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	KDX1	P36005	433 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	MRPL39	P36533	70 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YER076C	P40049	302 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YNL046W	P53956	172 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YPR098C	Q06089	161 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	FCY2	P17064	533 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YRB2	P40517	327 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	GLG2	P47011	380 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	RMR1	P53060	241 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	COX20	Q04935	205 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YEL067C	P39978	195 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	KAP114	P53067	1004 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	TRM12	Q04235	462 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	COX2	P00410	251 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YNR077C	P53758	84 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YPL162C	Q12042	273 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	RSR1	P13856	272 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	MEI4	P29467	408 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	GAA1	P39012	614 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YNL217W	P40152	326 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	YCT1	Q12235	531 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	TPO4	Q12256	659 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YKL063C	YKL063C	CDC8	P00572	216 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	ICE2	P40499	491 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	CAT5	P41735	233 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YJR056C	P47115	236 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YDR209C	Q03480	137 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	PDR18	P53756	1333 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 101.9 ms