RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	CUP9	P41817	306 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YGL262W	P53054	175 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	PRM8	P53174	237 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YMD8	Q03697	442 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MGR3	Q04472	501 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	GGA1	Q06336	557 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YLR413W	Q06689	675 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ATP16	Q12165	160 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	IES3	Q12345	250 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	HMS1	Q12398	434 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MRX4	Q12467	430 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	FSH3	Q99369	266 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	CCH1	P50077	2039 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YPR096C	O13587	100 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	GAL3	P13045	520 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	HSP150	P32478	413 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ECT1	P33412	323 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MRPS9	P38120	278 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	PEX32	P38292	413 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	SNL1	P40548	159 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	TIR3	P40552	269 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	EFM3	P47163	339 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YGR067C	P53243	804 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	VOA1	P53262	265 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YNR062C	P53748	327 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	NUP49	Q02199	472 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	SWP1	Q02795	286 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MAK3	Q03503	176 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	COX20	Q04935	205 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ATG17	Q06410	417 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
THP2	YHR167W	BTS1	Q12051	335 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	VPS13	Q07878	3144 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ITR2	P30606	609 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YHR180W	P38868	163 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	AVT6	P40074	448 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YIL086C	P40503	102 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	NAS2	P40555	220 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MSS2	P40990	351 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	NUP57	P48837	541 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YGR266W	P53326	701 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	DML1	Q03652	475 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	SNX41	Q04053	625 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	SMP3	Q04174	516 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	FSH2	Q05015	223 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RNH202	Q05635	350 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	SEI1	Q06058	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YLR446W	Q06204	433 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YPR172W	Q06608	200 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RRT8	Q08219	342 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	UIP4	Q08926	304 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	SPC3	Q12133	184 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MDM32	Q12171	622 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	NFI1	Q12216	726 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	CTA1	P15202	515 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	HSP30	P25619	332 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
THP2	YHR167W	LDS1	P31379	325 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	PDC2	P32896	925 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YKR015C	P36111	568 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YBR241C	P38142	488 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MPM1	P40364	252 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ICE2	P40499	491 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YFR054C	P43622	192 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ASI3	P53983	676 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YLR460C	P54007	376 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	PIN3	Q06449	215 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	HRT1	Q08273	121 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	AKR2	Q12013	749 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YOR214C	Q12282	236 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	YOL162W	P0CF19	215 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	PMT2	P31382	759 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	ARO7	P32178	256 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
THP2	YHR167W	YOR062C	P36025	268 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	JEN1	P36035	616 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	RIB1	P38066	345 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THP2	YHR167W	SHE1	P38200	338 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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