RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	HIS3	P06633	220 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	CHO1	P08456	276 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	CNE1	P27825	502 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	IMP1	P28627	190 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ARO7	P32178	256 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	UMP1	P38293	148 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	PAC2	P39937	518 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	MID1	P41821	548 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	BNA1	P47096	177 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	SKP1	P52286	194 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	MRH4	P53166	561 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	GPN3	Q06543	272 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	MDM36	Q06820	579 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	SOR2	Q07786	357 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YDL009C	Q12210	107 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	WHI5	Q12416	295 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ACH1	P32316	526 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	CPR5	P35176	225 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	PRM5	P40476	318 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YDR114C	Q04597	100 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ASR1	Q06834	288 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YOR029W	Q12243	111 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	EAF3	Q12432	401 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	SAP30	P38429	201 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	PIR5	P46999	287 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	GWT1	P47026	490 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	OKP1	P53298	406 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	CTF19	Q02732	369 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	CAC2	Q04199	468 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YLR283W	Q05867	314 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ATP10	P18496	279 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YKL063C	P35725	167 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	GPX2	P38143	162 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ATG18	P43601	500 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	BXI1	P48558	297 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YGL114W	P53134	725 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	MSA1	Q08471	629 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	ATG41	Q12048	136 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	BBP1	Q12365	385 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TRR2	YHR106W	PET122	P10355	254 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	IFM1	P25038	676 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	ATG22	P25568	528 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	DAL3	P32459	195 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	SEC66	P33754	206 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	YKL102C	P34249	101 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	PIC2	P40035	300 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	HNT2	P49775	206 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	WSC2	P53832	503 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	DUG3	P53871	357 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	MSH5	Q12175	901 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	ATG40	Q99325	256 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	MBA1	P38300	278 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	JLP2	P40206	208 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	DIE2	P50076	525 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	FMP42	Q04991	504 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	ECM31	P38122	312 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	PRE3	P38624	215 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	AIM46	P38885	310 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	TTI2	P47168	421 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	VHT1	P53241	593 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	CPR8	P53728	308 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RFM1	Q12192	310 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	VAM3	Q12241	283 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	REP2	P03872	296 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	AAC1	P04710	309 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	URA6	P15700	204 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.1 ms