RNA–Protein interactions for RNA: YHR077C

NMD2, Transcript of Protein involved in the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway, yeast

Gene NMD2, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD2	YHR077C	CTS2	Q06350	511 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	HUT1	Q12520	339 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	REP2	P03872	296 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SCEI	P03882	235 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	MET3	P08536	511 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	FIG1	P38224	298 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
NMD2	YHR077C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YJL193W	P39542	402 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YER158C	P40095	573 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	PHO23	P50947	330 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	ATG4	P53867	494 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	COA2	Q3E823	68 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	HBN1	Q96VH4	193 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	POP2	P39008	433 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YND1	P40009	630 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	PIC2	P40035	300 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YIL169C	P40442	995 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	XBP1	P40489	647 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	AGX1	P43567	385 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	BSC5	P53755	489 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	ARG5,6	Q01217	863 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	TPP1	Q03796	238 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	ASM4	Q05166	528 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YLR456W	Q06199	204 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	RRT7	Q07829	113 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YOL118C	Q08259	102 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	BLM10	P43583	2143 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	GAL1	P04385	528 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	ADH7	P25377	361 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	ERG2	P32352	222 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	RFC2	P40348	353 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	DLS1	P40366	167 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	HHO1	P53551	258 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SNO1	Q03144	224 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	RTT103	Q05543	409 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	NNT1	Q05874	261 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	TGS1	Q12052	315 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
NMD2	YHR077C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	RRI1	Q12468	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	QCR2	P07257	368 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	NAM9	P27929	486 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	AFG1	P32317	509 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YKL162C	P36052	402 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YKR073C	P36153	106 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SLZ1	P40167	298 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	CAF16	P43569	289 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	LOH1	P47055	219 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SNN1	P48232	102 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	CAF40	P53829	373 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YMR279C	Q03263	540 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YDR209C	Q03480	137 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	HNT3	Q08702	217 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SED4	P25365	1065 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	REC114	P32841	428 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	PDC2	P32896	925 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	CLB6	P32943	380 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	RPB7	P34087	171 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	LAG1	P38703	411 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	CUP9	P41817	306 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	MOB2	P43563	287 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	TNA1	P53322	534 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YDR248C	Q03786	193 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	YMR253C	Q04835	414 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	COQ11	Q05892	277 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SCP1	Q08873	200 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	SRL2	Q12020	392 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	COX19	Q3E731	98 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NMD2	YHR077C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	DAL82	P21705	255 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	LDS1	P31379	325 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	SSO2	P39926	295 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	YEA6	P39953	335 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	YIR035C	P40579	254 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	BUL1	P48524	976 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	SOL1	P50278	321 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	APJ1	P53940	528 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	SDC1	Q03323	175 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	YML018C	Q03730	393 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	YDR391C	Q04170	232 aa		2.59	□□□□□ -2
NMD2	YHR077C	DCS1	Q06151	350 aa		2.59	□□□□□ -2

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