RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	FAR10	Q06001	478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MRS1	P07266	363 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SEC22	P22214	214 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	ARO7	P32178	256 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	PAN6	P40459	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	AZF1	P41696	914 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	FMP32	P43557	207 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	CPR7	P47103	393 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	PIR3	Q03180	325 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	DYN3	Q04949	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	FUN26	P31381	517 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YBR062C	P38239	180 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TIM44	Q01852	431 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TDA1	Q03533	586 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YPD1	Q07688	167 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	HKR1	P41809	1802 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RAD50	P12753	1312 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TCA17	P32613	152 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
SYF1	YDR416W	PEX22	P39718	180 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	LCB3	P47013	409 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	COG7	P53195	279 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RFU1	Q08003	200 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	EAF3	Q12432	401 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	COS2	P0CX12	379 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	COS3	P0CX13	379 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TRX3	P25372	127 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MIX23	P38162	196 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	IKS1	P47042	667 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TPC1	P53257	314 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SDC1	Q03323	175 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	HRT3	Q12347	344 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	BBP1	Q12365	385 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	OAC1	P32332	324 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CHL4	P38907	458 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	IRC24	P40580	263 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	UFE1	P41834	346 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	AIM34	Q03673	198 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	GPX1	P36014	167 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	HOT13	P36078	116 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MBA1	P38300	278 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ECM14	P38836	430 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	HEM14	P40012	539 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SNX4	P47057	423 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	NRM1	P53718	249 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	LIP2	Q06005	328 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ATG15	P25641	520 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	PCI8	P40512	444 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YGR201C	P42936	225 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MAK3	Q03503	176 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	ERD2	P18414	219 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YCR023C	P25351	611 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MRPL39	P36533	70 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	YHL049C	P38722	271 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	SEN34	P39707	275 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	TRS65	P32893	560 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	CPR5	P35176	225 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	NVJ1	P38881	321 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	MAM33	P40513	266 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	UBC12	P52491	188 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	YDR416W	DYN2	Q02647	92 aa		3.51	□□□□□ -1.85

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