RNA–Protein interactions for RNA: YBL050W

SEC17, Transcript of Alpha-SNAP cochaperone, yeast

Gene SEC17, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC17	YBL050W	TRM10	Q12400	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HAP2	P06774	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SNF4	P12904	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	NUP1	P20676	1076 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AHC2	P25649	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	PRY2	P36110	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SRL3	P36167	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	MRPL39	P36533	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AIM18	P38884	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	EGT2	P42835	1041 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AVT4	P50944	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	VHT1	P53241	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YNL184C	P53876	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	TMA23	Q03525	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	COQ10	Q08058	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	THI20	Q08224	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	PHO2	P07269	559 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	PCL1	P24867	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YCR006C	P25350	157 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	TRS65	P32893	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	MRPL15	P36523	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	TRR2	P38816	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	PEX22	P39718	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YEA4	P40004	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YFL064C	P43540	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SOL1	P50278	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	TPN1	P53099	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	PRM8	P53174	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	FRE4	P53746	719 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	RHO4	Q00246	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	NHP10	Q03435	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SPG4	Q04438	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SHH4	Q06236	168 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	PHO85	P17157	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	CNB1	P25296	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YCR007C	P25354	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YCR041W	P37265	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	MRP21	P38175	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	ATG12	P38316	186 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	MED6	P38782	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	PCL5	P38794	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	CFD1	P40558	293 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	MNN5	P46982	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	AIM25	P47140	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	BUL1	P48524	976 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	AIF1	P52923	378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	FLC3	P53121	802 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YGL101W	P53144	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	HHO1	P53551	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SWS2	P53937	143 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SLM2	P53955	656 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	MCT1	Q12283	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	REV3	P14284	1504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	MHP1	P43638	1398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	MSI1	P13712	422 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	APS1	P35181	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SFK1	P35735	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SRY1	P36007	326 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	GPX2	P38143	162 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	POP8	P38208	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	ARN1	P38731	627 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	SIM1	P40472	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	APQ12	P40532	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	OST2	P46964	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	XPT1	P47165	209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	ORC5	P50874	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	UBC12	P52491	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YGR039W	P53225	103 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	ATP23	P53722	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YNR048W	P53740	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YDR366C	P87287	132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEC17	YBL050W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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