RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NARSO43776 548 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8AP07357 584 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMP2P13473 410 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1D2P34982 312 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM2P49736 904 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB33AQ14088 237 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPZL3Q6UWV2 235 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKAL1Q6UXT8 129 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLIN2Q99541 437 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTRRQ9UBK8 725 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROZP22891 400 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSHRP23945 695 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STRN3Q13033 797 aa28.69■■■□□ 2.18
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIX5Q8N196 739 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC44A3Q8N4M1 653 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPIRE2Q8WWL2 714 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX27Q96L92 541 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACAP3Q96P50 834 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOCK8Q8NF50 2099 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLS3P13797 630 aa28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TKTP29401 623 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXA9P31269 272 aa28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMTNP53814 917 aa28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 I3L4J1 428 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABLIM1O14639 778 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XYLBO75191 536 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFHP08603 1231 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G4BP0C869 781 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPR3P17342 541 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRCC3P46736 316 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC12A3P55017 1021 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKS3Q6ZW76 656 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A14Q8TBB6 771 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCND2Q9NZV8 630 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT16Q9UBV4 365 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLIQ9UNA4 740 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BACE2Q9Y5Z0 518 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL16O15467 120 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNE1P15382 129 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AOC1P19801 751 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANHXE9PGG2 379 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PODXLO00592 558 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOM1L1O75674 476 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRFP11831 508 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTHL1P78549 312 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTR4Q13639 388 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UVSSAQ2YD98 709 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM119Q4V9L6 283 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AK8Q96MA6 479 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTN3Q9P232 1028 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH11P35749 1972 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPTP10636 758 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZPBP2Q6X784 338 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTP3Q9BQQ7 232 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH7Q9ULB5 785 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC26A4O43511 780 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PI15O43692 258 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU2F2P09086 479 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL9P32969 192 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTL10Q7L3V2 364 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUMBLQ9Y6R0 609 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CITO14578 2027 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP34Q70CQ2 3546 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK25O00506 426 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARSHQ5FYA8 562 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALML4Q96GE6 196 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA14Q9ULX7 337 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUB1Q9Y5A7 615 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOCK6Q96HP0 2047 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRBA1A5PL33 1030 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YCG3 227 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN3O15551 220 aa28.61■■■□□ 2.17
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