RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	DRE2	P36152	348 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	OTU1	P43558	301 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	GOT1	Q03554	138 aa		3.07	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	MAL32	P38158	584 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	MSS2	P40990	351 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	RPC17	P47076	161 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	MAL12	P53341	584 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	HIS3	P06633	220 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	CAB3	P36076	571 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	EMI1	Q04406	187 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YPR011C	Q12251	326 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	CCH1	P50077	2039 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YCR102C	P25608	368 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	RNP1	P32385	249 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YKL075C	P36083	450 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YOR186W	Q08560	144 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	ECM13	P38195	257 aa		3.03	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	COX15	P40086	486 aa		3.03	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YGL034C	P53186	121 aa		3.03	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	YLR126C	Q12288	251 aa		3.03	□□□□□ -1.92
HMS1	YOR032C	MET2	P08465	486 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	DOA4	P32571	926 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YER189W	P40104	122 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	MDM34	P53083	459 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	PGA2	P53903	129 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	DCR2	Q05924	578 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SEI1	Q06058	285 aa		3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	PPH21	P23594	369 aa		3.01	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	PBN1	P25580	416 aa		3.01	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	MIC12	P38341	106 aa		3.01	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YGL088W	P53151	121 aa		3.01	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	GEP5	Q12393	293 aa		3.01	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YPR096C	O13587	100 aa		3	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	RAD10	P06838	210 aa		3	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	COQ1	P18900	473 aa		3	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YMR31	P19955	123 aa		3	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SSO1	P32867	290 aa		3	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	EMP46	Q12396	444 aa		3	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SPO73	P40031	143 aa		2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YNL046W	P53956	172 aa		2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	GRX3	Q03835	250 aa		2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	FEX1	Q08913	375 aa		2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	FEX2	Q08991	375 aa		2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	AGC1	Q12482	902 aa		2.99	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YLR462W	O13556	202 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	ARG80	P07249	177 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SNA3	P14359	133 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SEC22	P22214	214 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	MIG1	P27705	504 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YEL075C	P39972	122 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YER084W	P40057	128 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YJL144W	P47009	104 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	MCM22	P47167	239 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	TRM9	P49957	279 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	NCB2	Q92317	146 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SEY1	Q99287	776 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SWI1	P09547	1314 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	KRE1	P17260	313 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	ERD2	P18414	219 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	STE18	P18852	110 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	RIB1	P38066	345 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	GON7	P46984	123 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	MIC26	P50087	233 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	CDC123	Q05791	360 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	GIS3	Q12418	502 aa		2.97	□□□□□ -1.93
HMS1	YOR032C	SPT3	P06844	337 aa		2.96	□□□□□ -1.93

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