RNA–Protein interactions for RNA: YKR062W

TFA2, Transcript of TFIIE small subunit, yeast

Gene TFA2, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFA2	YKR062W	SAC3	P46674	1301 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	COS2	P0CX12	379 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	COS3	P0CX13	379 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	JEN1	P36035	616 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	ECM13	P38195	257 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	YHL026C	P38740	315 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	YAR1	P46683	200 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	USE1	P53146	245 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	MRPL50	P53724	139 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	YOR268C	Q08734	132 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	CHD1	P32657	1468 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	PPH21	P23594	369 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	BIG1	P38813	335 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	COG3	P40094	801 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	SLM2	P53955	656 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	BBP1	Q12365	385 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	SAS5	Q99314	248 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	SEC22	P22214	214 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	BNA6	P43619	295 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	PEX12	Q04370	399 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	YLR173W	Q06247	608 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	MED4	Q12343	284 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TFA2	YKR062W	MSF1	P08425	469 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	MRX3	P38172	270 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SCO1	P23833	295 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	RCN1	P36054	211 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SPG4	Q04438	115 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	VPS68	Q12016	184 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	COS8	P38723	381 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	TCD1	P38756	429 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SNZ3	P43545	298 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	OST2	P46964	130 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	MRH4	P53166	561 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	PET117	Q02771	107 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	MHT1	Q12525	324 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YJR146W	P47174	117 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	CSM4	Q08955	156 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	EMC6	Q12431	108 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SWI1	P09547	1314 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	PUT1	P09368	476 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	MSN4	P33749	630 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YER189W	P40104	122 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
TFA2	YKR062W	CTF19	Q02732	369 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SRL4	Q03085	281 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YCT1	Q12235	531 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	YOR029W	Q12243	111 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SCM4	P32564	187 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	FMC1	P40491	155 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SNX4	P47057	423 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	CGR1	P53188	120 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	COS6	P53344	381 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SNZ2	P53824	298 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	PRM15	Q03262	622 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	PAM18	Q07914	168 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	COQ10	Q08058	207 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	MSH5	Q12175	901 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	DOA4	P32571	926 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
TFA2	YKR062W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	EMP46	Q12396	444 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TFA2	YKR062W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	YLR462W	O13556	202 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	QCR6	P00127	147 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	SGA1	P08019	549 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	CCA1	P21269	546 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	SRB4	P32569	687 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	GOS1	P38736	223 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	YEL075C	P39972	122 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	YER085C	P40058	173 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	MSS2	P40990	351 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	GLG2	P47011	380 aa		2.58	□□□□□ -2
TFA2	YKR062W	YGR026W	P53217	278 aa		2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms