RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TDA6	Q06466	467 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	STP4	Q07351	490 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CRT10	Q08226	957 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CNE1	P27825	502 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PRO1	P32264	428 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SDS24	P38314	527 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	POP2	P39008	433 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ACA1	P39970	489 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	VPS25	P47142	202 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YGR017W	P53210	297 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TAZ1	Q06510	381 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	FDH1	Q08911	376 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SRN2	Q99176	213 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	HAP4	P14064	554 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YCR100C	P25606	316 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	GWT1	P47026	490 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PIR3	Q03180	325 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ERS1	P17261	260 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	QDR3	P38227	689 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YBR096W	P38256	230 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	UMP1	P38293	148 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	EFM1	P38732	585 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	AVT7	P40501	490 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CDC1	P40986	491 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	BUD8	P41698	603 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YJR056C	P47115	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	LYS5	P50113	272 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MSC1	Q03104	513 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SNF5	P18480	905 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	BOS1	P25385	244 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ADE1	P27616	306 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	RPP1	P38786	293 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TIM17	P39515	158 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YEA6	P39953	335 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	FMC1	P40491	155 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ATG27	P46989	271 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MTO1	P53070	669 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	VHT1	P53241	593 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	FPK1	P53739	893 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PGA1	P53896	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YMR206W	Q03695	313 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TPO4	Q12256	659 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	IZH2	Q12442	317 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
MTR4	YJL050W	DAL82	P21705	255 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MAK32	P23060	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SCO1	P23833	295 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
MTR4	YJL050W	PPZ2	P33329	710 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	GCS1	P35197	352 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	AIM29	P36154	155 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YIL165C	P40446	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YJR124C	P47159	448 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YGR149W	P48236	432 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YDL157C	Q12082	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	STP22	P25604	385 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	ATG15	P25641	520 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	PUG1	P40100	303 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YJR120W	P47157	116 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YGL262W	P53054	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	STF1	P01098	86 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	GAL4	P04386	881 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	MSF1	P08425	469 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR4	YJL050W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.7 ms