RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	OST3	P48439	350 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	MRH4	P53166	561 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	FMP48	P53233	369 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	PDR17	P53844	350 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	RTC4	P53850	401 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	AAH1	P53909	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YNG1	Q08465	219 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	TRM10	Q12400	293 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	MRX4	Q12467	430 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	PSK1	P31374	1356 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	POP8	P38208	133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YHL049C	P38722	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	TIM17	P39515	158 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	BXI1	P48558	297 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	GTR2	P53290	341 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	MRX11	Q03079	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	HRT3	Q12347	344 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	COX5A	P00424	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	GCN3	P14741	305 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	TIP20	P33891	701 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YIL054W	P40524	105 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YIL012W	P40551	113 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	IGD1	P43598	195 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	CPR7	P47103	393 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YIP3	P53633	176 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	PHO2	P07269	559 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	MET2	P08465	486 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	ERG2	P32352	222 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	SPS18	P32572	300 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	MRPL28	P36527	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	AME1	P38313	324 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	AVT6	P40074	448 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	LOA1	Q06508	300 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	PHO80	P20052	293 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	EPT1	P22140	391 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	MIG3	P39943	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YNL140C	P53910	189 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	RMI1	Q02685	241 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	VHS1	Q03785	461 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	PEX12	Q04370	399 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	GRE1	Q08969	168 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	MDM32	Q12171	622 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VMA22	YHR060W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	PUT1	P09368	476 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ERD2	P18414	219 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	DBF2	P22204	572 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	HMT1	P38074	348 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	GPI18	P38211	433 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	FIG1	P38224	298 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	COG3	P40094	801 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	FAR7	P43592	221 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YLR460C	P54007	376 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	SNO1	Q03144	224 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	INP1	Q03694	420 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	API2	Q04413	109 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	CKA2	P19454	339 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	MGT1	P26188	188 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	APS1	P35181	156 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	SEO1	P39709	593 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	GAB1	P41733	394 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	RPE1	P46969	238 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YGL262W	P53054	175 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YGL118C	P53132	145 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	TOS8	P53147	276 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	NRK1	P53915	240 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YNL046W	P53956	172 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.5	□□□□□ -1.85	not detected
VMA22	YHR060W	YCR025C	P25352	136 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	ECM14	P38836	430 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	PRM8	P53174	237 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	YGL034C	P53186	121 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VMA22	YHR060W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85

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