RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	YCR102C	P25608	368 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	HSP30	P25619	332 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	JEN1	P36035	616 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.61	□□□□□ -1.83	not detected
SLX1	YBR228W	ARN2	P38724	620 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YHR180W	P38868	163 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	CHL4	P38907	458 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	STB1	P42845	420 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RPE1	P46969	238 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YGL101W	P53144	215 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	APJ1	P53940	528 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YDR209C	Q03480	137 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	OST6	Q03723	332 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RNH1	Q04740	348 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	BUR2	Q05949	395 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	BTS1	Q12051	335 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MCP1	Q12106	302 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MDM32	Q12171	622 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MEC1	P38111	2368 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.6	□□□□□ -1.83	not detected
SLX1	YBR228W	ELO2	P25358	347 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YEF1	P32622	495 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GPX1	P36014	167 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	TPO5	P36029	618 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YKL071W	P36086	256 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YKR015C	P36111	568 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	POP1	P41812	875 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MDE1	P47095	244 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PGU1	P47180	361 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PGA1	P53896	198 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	NUP49	Q02199	472 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YDR249C	Q03787	373 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	FIN1	Q03898	291 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SNX41	Q04053	625 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	COQ10	Q08058	207 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YPL199C	Q08954	240 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RLM1	Q12224	676 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.83	not detected
SLX1	YBR228W	SCO1	P23833	295 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	EHD3	P28817	500 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PUP2	P32379	260 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.83	not detected
SLX1	YBR228W	MSN4	P33749	630 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YHR035W	P38769	630 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	FET3	P38993	636 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	NAS2	P40555	220 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	REE1	P40893	198 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ECO1	P43605	281 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	EFM3	P47163	339 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	RRN9	P53437	365 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	SPC19	Q03954	165 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	MIX14	Q04341	121 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	COX20	Q04935	205 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	HRT1	Q08273	121 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YRM1	Q12340	786 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PCL9	Q12477	304 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YOR343C	Q12484	108 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	CTA1	P15202	515 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	PHO80	P20052	293 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	SUR1	P33300	382 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	MAL32	P38158	584 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	SHE1	P38200	338 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	PHB1	P40961	287 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	MAL12	P53341	584 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	MNT4	P53745	580 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	SDC1	Q03323	175 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	MAK3	Q03503	176 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	NEJ1	Q06148	342 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	YLR173W	Q06247	608 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	TAZ1	Q06510	381 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	IRC19	Q07843	230 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	MTR10	Q99189	972 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	KIN28	P06242	306 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	ARO7	P32178	256 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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