RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	FLO9	P39712	1322 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YCR102C	P25608	368 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	NAM9	P27929	486 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SDH8	P38345	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	RTT105	P40063	208 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	REE1	P40893	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	IKS1	P47042	667 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ASI3	P53983	676 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PET191	Q02772	108 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	RSM10	Q03201	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SDC1	Q03323	175 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	AIM36	Q03798	255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MRX8	Q05473	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SSK1	Q07084	712 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MCH4	Q08268	501 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MDM32	Q12171	622 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PET54	P10834	293 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	STE18	P18852	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MDH2	P22133	377 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	DBF2	P22204	572 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ATS1	P31386	333 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	APD1	P38281	316 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HPA3	P39979	161 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SHO1	P40073	367 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ECO1	P43605	281 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MSY1	P48527	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MIX14	Q04341	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ORM2	Q06144	216 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ASR1	Q06834	288 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	INP53	Q12271	1107 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MTR10	Q99189	972 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PDX1	P16451	410 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	UTR1	P21373	530 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HYM1	P32464	399 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	KRE6	P32486	720 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SPT10	P35208	640 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	LNP1	P38878	278 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MNN5	P46982	586 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PCP1	P53259	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	BSC5	P53755	489 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YLR152C	P54072	576 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ACS1	Q01574	713 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PEX30	Q06169	523 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	KEI1	Q06346	221 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	CTS2	Q06350	511 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YRM1	Q12340	786 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ORT1	Q12375	292 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MSW1	P04803	379 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	GCN3	P14741	305 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SEC62	P21825	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ATG22	P25568	528 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ITR1	P30605	584 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PPQ1	P32945	549 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	CLG1	P35190	452 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PUG1	P40100	303 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YIL169C	P40442	995 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YGR066C	P53242	292 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MTM1	P53320	366 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ATP23	P53722	227 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	NNT1	Q05874	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HEM25	Q07534	307 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SCEI	P03882	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	SPS2	P08459	502 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	PRB1	P09232	635 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	SPO7	P18410	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	ERG9	P29704	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	FRM2	P37261	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	YHR122W	P38829	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	SLZ1	P40167	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	XBP1	P40489	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	YIL060W	P40519	144 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	DIE2	P50076	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	POP6	P53218	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROX3	YBL093C	FMP48	P53233	369 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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