RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	TPO4	Q12256	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PHO80	P20052	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MRPL3	P36516	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	COG3	P40094	801 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PAN6	P40459	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	NCA3	P46955	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	COG7	P53195	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	TPC1	P53257	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SHY1	P53266	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	FSH2	Q05015	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	LDS1	P31379	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YOX1	P34161	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SEO1	P39709	593 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	RPR2	P40571	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	PDR17	P53844	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SPG4	Q04438	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SEI1	Q06058	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	LOA1	Q06508	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ATP16	Q12165	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	TRP1	P00912	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
URA7	YBL039C	SPS18	P32572	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YBR062C	P38239	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	CLD1	P53264	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	GTR2	P53290	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YNR066C	P53752	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	MSI1	P13712	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
URA7	YBL039C	MDM31	P38880	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YJR056C	P47115	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	NRK1	P53915	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	HNT3	Q08702	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SFM1	Q12314	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	STE7	P06784	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ATS1	P31386	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	GPX1	P36014	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	MBA1	P38300	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YFL067W	P43537	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SDC1	Q03323	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	MRX4	Q12467	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	RPB5	P20434	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	GIT1	P25346	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	PRM5	P40476	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	RIF2	Q06208	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	MIM1	Q08176	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	MET2	P08465	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ATG15	P25641	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	MRPL28	P36527	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	BNR1	P40450	1375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	CPT1	P17898	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	MRPL39	P36533	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	TOS8	P53147	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SDS23	P53172	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	JAC1	P53193	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	FMP42	Q04991	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	INM2	Q05533	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ERV2	Q12284	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	DBF2	P22204	572 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SRY1	P36007	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	ECM13	P38195	257 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	DER1	P38307	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	SOK1	P40317	901 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YIL152W	P40455	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA7	YBL039C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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