RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	HSP30	P25619	332 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ARO7	P32178	256 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SRY1	P36007	326 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SER33	P40510	469 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MOB2	P43563	287 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TOS8	P53147	276 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	IRC15	Q02733	499 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TAF9	Q05027	157 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SEI1	Q06058	285 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	THI72	Q08579	599 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MCT1	Q12283	360 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PRM4	Q12498	284 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SNT2	P53127	1403 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MRS1	P07266	363 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	AQY1	P0CD91	305 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CSG2	P35206	410 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RRG9	P40156	214 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SCS7	Q03529	384 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YET2	Q04210	160 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YLR446W	Q06204	433 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TPO3	Q06451	622 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YLR030W	Q07967	263 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SLM3	Q12093	417 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RFM1	Q12192	310 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	LTE1	P07866	1435 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	GCN3	P14741	305 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YCR023C	P25351	611 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MED8	P38304	223 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SLM6	P38343	150 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	GAT1	P43574	510 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	BXI1	P48558	297 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ATP23	P53722	227 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CSN9	Q03981	162 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SPG4	Q04438	115 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PFA4	Q12006	378 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PEX11	Q12462	236 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RAX2	Q12465	1220 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	EPT1	P22140	391 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	LEU5	P38702	357 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ECM14	P38836	430 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RMD6	P39975	231 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	GWT1	P47026	490 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	IKS1	P47042	667 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ARK1	P53974	638 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TIM44	Q01852	431 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YPL062W	Q02781	134 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SWP1	Q02795	286 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YPL034W	Q03083	165 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	GMC1	Q04399	608 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MCA1	Q08601	432 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	FRE8	Q12209	686 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	AVT5	P38176	459 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
TOP1	YOL006C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	NVJ1	P38881	321 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YMD8	Q03697	442 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CPR4	P25334	318 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	OAC1	P32332	324 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MTC6	P38849	526 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PET8	P38921	284 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	EGT2	P42835	1041 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YNL234W	P53857	426 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YML018C	Q03730	393 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	IRC10	Q08118	586 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	AIM39	Q08223	395 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YOL073C	Q08232	322 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	AKR2	Q12013	749 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PCL9	Q12477	304 aa		2.91	□□□□□ -1.94

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