RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W CRF1Q04930 467 aa4.85□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W PLB3Q08108 686 aa4.85□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W SRL2Q12020 392 aa4.85□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W PRR2Q12310 699 aa4.85□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W MES1P00958 751 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W YFL068WP0CX99 160 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W YLL066W-AP0CY00 160 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W YLL067W-AP0CY01 160 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W SAM35P14693 329 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W LSB5P25369 354 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W GEX1P25596 615 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W YCR015CP25616 317 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W URA10P30402 227 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W GLC7P32598 312 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W PHD1P36093 366 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W POP8P38208 133 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W YHL044WP38727 235 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W YIL060WP40519 144 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W LYS5P50113 272 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W SGF73P53165 657 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W SAY1P53324 424 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W LSM3P57743 89 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W TIM8P57744 87 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W TY1A-MR1Q04215 440 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W IPK1Q06667 281 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W GPB1Q08886 897 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W RDI1Q12434 202 aa4.84□□□□□ -1.63
RRN3YKL125W SIR2P06700 562 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W GDH1P07262 454 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W SCL1P21243 252 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W SLM5P25345 492 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W UGX2P32772 223 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W OMA1P36163 345 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W ASC1P38011 319 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YHR210CP38893 341 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YEL057CP39983 233 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W SNU13P39990 126 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W LYS12P40495 371 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W EXG2P52911 562 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W GPG1P53130 126 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W FRE4P53746 719 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YLR030WQ07967 263 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W THP1Q08231 455 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W FRE6Q12473 712 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YPL247CQ12523 523 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YCR075W-AQ3E830 75 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W HKR1P41809 1802 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W HIS1P00498 297 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W PHO2P07269 559 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W SRD1P09007 221 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W PUT1P09368 476 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YML003WP0CF16 290 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W PDA1P16387 420 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data4.83□□□□□ -1.64not detected
RRN3YKL125W HOG1P32485 435 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W CDC5P32562 705 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YHR177WP38867 453 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W SEC72P39742 193 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W NAS2P40555 220 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W BUL1P48524 976 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W RSM10Q03201 203 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W FIT1Q04433 528 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W AIM33Q04516 312 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W AVO2Q04749 426 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W CDD1Q06549 142 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W ATG41Q12048 136 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W TMS1Q12116 473 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W NDJ1Q12366 352 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W SFG1Q12507 346 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YJR112W-AQ3E743 109 aa4.83□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W ERG3P32353 365 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W SRB5P32585 307 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W MCH2P36032 473 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W HTD2P38790 280 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W MPM1P40364 252 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W FKH2P41813 862 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W GPI14P47088 403 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YIP4P53093 235 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W PUS2P53167 370 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W PNC1P53184 216 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W BOR1P53838 576 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W GOT1Q03554 138 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W GUD1Q07729 489 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W NBP2Q12163 236 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W YLR099W-AQ3E798 87 aa4.82□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W TPI1P00942 248 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W MSW1P04803 379 aa4.81□□□□□ -1.64
RRN3YKL125W UTR5P32630 166 aa4.81□□□□□ -1.64
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