RNA–Protein interactions for RNA: YKL095W

YJU2, Transcript of Essential protein required for pre-mRNA splicing, yeast

Gene YJU2, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJU2	YKL095W	TPO4	Q12256	659 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	GIT1	P25346	518 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	SPS18	P32572	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	DRE2	P36152	348 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	XBP1	P40489	647 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	PCI8	P40512	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YKE4	P40544	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YJL016W	P47072	561 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	OST3	P48439	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	COS10	P52924	374 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	SPG4	Q04438	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	LOA1	Q06508	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YNG1	Q08465	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	PUT1	P09368	476 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	PHO80	P20052	293 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	CPR4	P25334	318 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	ATG15	P25641	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	FIG1	P38224	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	MBA1	P38300	278 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YJL213W	P40896	331 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YLR460C	P54007	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	SNO1	Q03144	224 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	PEX12	Q04370	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	SEI1	Q06058	285 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	ARR2	Q06597	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YND1	P40009	630 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	COG3	P40094	801 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	GAB1	P41733	394 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	EGT2	P42835	1041 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	SDS23	P53172	527 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	GTR2	P53290	341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	PDR17	P53844	350 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	ADD37	Q03233	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	SDC1	Q03323	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJU2	YKL095W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
YJU2	YKL095W	MEI4	P29467	408 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	SDH3	P33421	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	MRPL39	P36533	70 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YCR043C	P25361	127 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	ASK1	P35734	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YHL049C	P38722	271 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	MDM31	P38880	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	SEN34	P39707	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YIL067C	P40514	678 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YJR056C	P47115	236 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	DXO1	Q06349	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	HNT3	Q08702	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	JID1	Q12350	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	MRX4	Q12467	430 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	PHO2	P07269	559 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	DBF2	P22204	572 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	SEO1	P39709	593 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	AVT7	P40501	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	ATG18	P43601	500 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YJR054W	P47114	497 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	BNS1	P50084	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	TOS8	P53147	276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	CRH1	P53301	507 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	NRK1	P53915	240 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	COX5A	P00424	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	CSE2	P33308	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	YOX1	P34161	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	SRY1	P36007	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	MRPL28	P36527	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	FRM2	P37261	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	CPR7	P47103	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	BIR1	P47134	954 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJU2	YKL095W	BXI1	P48558	297 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20 ms