RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	CSM1	P25651	190 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.67	□□□□□ -2.3	not detected
YKL063C	YKL063C	VAC14	Q06708	880 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	PET18	P25362	215 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YBR219C	P38317	127 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	VOA1	P53262	265 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	CPD1	P53314	239 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	SFH1	Q06168	426 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YKL063C	YKL063C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.65	□□□□□ -2.31	not detected
YKL063C	YKL063C	DRE2	P36152	348 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	TDA11	P38854	504 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	BMT5	P40493	336 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	CYT2	Q00873	224 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	MRPS8	Q03799	155 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	VBA1	Q04301	562 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SEC10	Q06245	871 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	GPN3	Q06543	272 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	RAD3	P06839	778 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	POF1	P25576	258 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PEX3	P28795	441 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PEX4	P29340	183 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	HIS2	P38635	335 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	OST2	P46964	130 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	DAD3	P69850	94 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	RRG8	Q06109	277 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	ATO3	Q12359	275 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	YOS9	Q99220	542 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SPT7	P35177	1332 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	CCA1	P21269	546 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SWI3	P32591	825 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	RPC25	P35718	212 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PRM10	P42946	383 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	NBP35	P52920	328 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	YGL034C	P53186	121 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SWS2	P53937	143 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	ARV1	Q06541	321 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	CTR3	Q06686	241 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	CSI2	Q08054	341 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PGC1	Q08959	321 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	BBP1	Q12365	385 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	CWP1	P28319	239 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	RCN1	P36054	211 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	CTR2	P38865	189 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	LOH1	P47055	219 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PRM15	Q03262	622 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	DCN1	Q12395	269 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SEC22	P22214	214 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PRM9	P39551	298 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	OSW5	P40219	148 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	DSF1	P0CX08	502 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	UGA1	P17649	471 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	YHR022C	P38763	256 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	SWI1	P09547	1314 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	YGL010W	P25338	174 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YKL063C	YKL063C	Q0255	P03881	472 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	YBR220C	P38318	560 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	RCY1	P39531	840 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	YGL185C	P53100	379 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	PEX10	Q05568	337 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	PER33	Q12144	273 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	MDH2	P22133	377 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	MSA2	P36157	363 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	DOG1	P38774	246 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.57	□□□□□ -2.32	not detected
YKL063C	YKL063C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	YHR125W	P38831	101 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.56	□□□□□ -2.32	not detected
YKL063C	YKL063C	TIM21	P53220	239 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	YNL050C	P53952	270 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	AKR2	Q12013	749 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	EMP46	Q12396	444 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YKL063C	YKL063C	YSR3	P23501	404 aa		0.55	□□□□□ -2.32

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