RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	PCL9	Q12477	304 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SET6	Q12529	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PRB1	P09232	635 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	HOM3	P10869	527 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ZRC1	P20107	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RBK1	P25332	333 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	CDC50	P25656	391 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MSS51	P32335	436 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	DOA4	P32571	926 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	THI2	P38141	450 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PAU24	P38155	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YHR177W	P38867	453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RTS2	P40962	232 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	OKP1	P53298	406 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PAU12	P53343	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	NRK1	P53915	240 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
POP4	YBR257W	PIR3	Q03180	325 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SMA2	Q04658	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	STP3	Q05937	343 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	BTS1	Q12051	335 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	CDC7	P06243	507 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	HAP2	P06774	265 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YPK2	P18961	677 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MRPL44	P19956	98 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	EPT1	P22140	391 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	POF1	P25576	258 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ITR1	P30605	584 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	FUN26	P31381	517 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	CLB6	P32943	380 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SKN1	P33336	771 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PXA2	P34230	853 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SSS1	P35179	80 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SOL2	P37262	315 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SDH4	P37298	181 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	DTR1	P38125	572 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SRO77	P38163	1010 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	CHL4	P38907	458 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YER010C	P40011	234 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	IDP2	P41939	412 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	EAF6	P47128	113 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	DAN1	P47178	298 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SOL1	P50278	321 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PKP2	P53170	491 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SWC4	P53201	476 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YNL143C	P53908	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YNL140C	P53910	189 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	TEN1	Q07921	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SPC3	Q12133	184 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	FSH3	Q99369	266 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	POX1	P13711	748 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MRPL8	P22353	238 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ATS1	P31386	333 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MKK1	P32490	508 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	COS9	P36034	407 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PEX32	P38292	413 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	VMA21	P41806	77 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	IBA57	P47158	497 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YGL185C	P53100	379 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YGR015C	P53208	328 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YGR079W	P53249	370 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RSM27	P53305	110 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YNR062C	P53748	327 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	GPI15	P53961	229 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	IZH1	Q03419	316 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SNO4	Q04902	237 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	BOP2	Q06150	570 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PEX30	Q06169	523 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	DCI1	Q08558	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	HSP32	Q08992	237 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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