RNA–Protein interactions for RNA: snR34

snR34, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR34, Length 203 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR34	snR34	YNL095C	P53932	642 aa		3.17	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	YKL070W	P36087	169 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	SPL2	P38839	148 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	SUR2	P38992	349 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	YER188W	P40103	239 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	MND1	P53102	219 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	VBA1	Q04301	562 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	YPL150W	Q12152	901 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR34	snR34	HIS3	P06633	220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	ATG12	P38316	186 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	PEX18	P38855	283 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YPL039W	Q03080	316 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	LOA1	Q06508	300 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	FMP33	P46998	180 aa		3.14	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	MRX5	P47007	382 aa		3.14	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	OST3	P48439	350 aa		3.14	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	SDC1	Q03323	175 aa		3.14	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	SFH1	Q06168	426 aa		3.14	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	PEX3	P28795	441 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	SPP2	Q02521	185 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	SEC10	Q06245	871 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	CDD1	Q06549	142 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	ARN2	P38724	620 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YHI9	P38765	294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	MED6	P38782	295 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	PIR5	P46999	287 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	LSB1	P53281	241 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YOS9	Q99220	542 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	RRT12	P25381	491 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	POF1	P25576	258 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	SER33	P40510	469 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	RGM1	Q00453	211 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YMR166C	Q03829	368 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YOL019W	Q08157	551 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	HMT1	P38074	348 aa		3.1	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	CDC14	Q00684	551 aa		3.1	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	PER33	Q12144	273 aa		3.1	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	AGC1	Q12482	902 aa		3.1	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	COY1	P34237	679 aa		3.09	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	CSG2	P35206	410 aa		3.09	□□□□□ -1.91
snR34	snR34	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	ARV1	Q06541	321 aa		3.08	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.08	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	SHC1	P39000	512 aa		3.07	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	TIM21	P53220	239 aa		3.07	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	HSM3	P38348	480 aa		3.06	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	GMC2	Q06201	188 aa		3.06	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	CTS2	Q06350	511 aa		3.06	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	CTR3	Q06686	241 aa		3.06	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	STH1	P32597	1359 aa		3.05	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
snR34	snR34	COA1	P40452	197 aa		3.05	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	TAD2	P47058	250 aa		3.05	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	MNT4	P53745	580 aa		3.05	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	COS2	P0CX12	379 aa		3.04	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	COS3	P0CX13	379 aa		3.04	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	NBP35	P52920	328 aa		3.04	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	NIF3	P53081	288 aa		3.04	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	SWS2	P53937	143 aa		3.04	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	RAD10	P06838	210 aa		3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	SNF6	P18888	332 aa		3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	SFC1	P33303	322 aa		3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	RCY1	P39531	840 aa		3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	ATC1	Q04005	294 aa		3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	YOR268C	Q08734	132 aa		3.03	□□□□□ -1.92
snR34	snR34	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
snR34	snR34	YHL049C	P38722	271 aa		3.02	□□□□□ -1.93
snR34	snR34	YJL028W	P47062	111 aa		3.02	□□□□□ -1.93
snR34	snR34	DSK2	P48510	373 aa		3.02	□□□□□ -1.93
snR34	snR34	KAP114	P53067	1004 aa		3.02	□□□□□ -1.93
snR34	snR34	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
snR34	snR34	PLB3	Q08108	686 aa		3.02	□□□□□ -1.93
snR34	snR34	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93

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