RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	NAM2	P11325	894 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SUR1	P33300	382 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RTC2	P38279	296 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YBR197C	P38306	217 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ERP5	P38819	212 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YHR218W	P38899	603 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	IDS2	P46958	469 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YJL016W	P47072	561 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YGR168C	P53293	376 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YNL033W	P53964	284 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YNL019C	P53975	284 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RNT1	Q02555	471 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YMR166C	Q03829	368 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GTB1	Q04924	702 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	BRE4	Q07660	1125 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RRI1	Q12468	440 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MHF2	Q3E829	80 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SIR2	P06700	562 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ATP7	P30902	174 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MTC7	P32633	139 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RPC34	P32910	317 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PEX6	P33760	1030 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MRP8	P35719	219 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RMD6	P39975	231 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ATF1	P40353	525 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	IAH1	P41734	238 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	STB1	P42845	420 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GTR1	Q00582	310 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	UGO1	Q03327	502 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	DLT1	Q04216	342 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GGA1	Q06336	557 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GPI11	Q06636	219 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.61	□□□□□ -1.83	not detected
YNL057W	YNL057W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SCEI	P03882	235 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SNF6	P18888	332 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	NTG1	P31378	399 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ISC10	P32645	267 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YOX1	P34161	385 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RFC3	P38629	340 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	FLO5	P38894	1075 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	NTA1	P40354	457 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	TIR3	P40552	269 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YGL101W	P53144	215 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	USE1	P53146	245 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YMR102C	Q03177	834 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	AIM36	Q03798	255 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	TMA10	Q06177	86 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PSR1	Q07800	427 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GSH2	Q08220	491 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SIA1	Q12212	622 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MSN1	P22148	382 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PRE4	P30657	266 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	TCA17	P32613	152 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RIB1	P38066	345 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	CCZ1	P38273	704 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	TRM5	P38793	499 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	CTF8	P38877	133 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	FIP1	P45976	327 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	CTK2	P46962	323 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GON7	P46984	123 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GET1	P53192	235 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GPI1	P53306	609 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	CAC2	Q04199	468 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	CYC7	P00045	113 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	CMK2	P22517	447 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	REC114	P32841	428 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	LTV1	P34078	463 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PIR5	P46999	287 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	BNA1	P47096	177 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	AVT4	P50944	713 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YGL114W	P53134	725 aa		3.59	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.4 ms