RNA–Protein interactions for RNA: YJL217W

REE1, Transcript of Cytoplasmic protein involved in the regulation of enolase (ENO1), yeast

Gene REE1, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REE1	YJL217W	NCA3	P46955	337 aa		3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	LCB3	P47013	409 aa		3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	HCH1	P53834	153 aa		3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.38	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
REE1	YJL217W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ERG9	P29704	444 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ZIP1	P31111	875 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MEI5	P32489	222 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	KAR9	P32526	644 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	TKL2	P33315	681 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ECM4	P36156	370 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YHL026C	P38740	315 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	COX14	P39103	70 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RPR2	P40571	144 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RTT101	P47050	842 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	PEX31	P53203	462 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	CDC14	Q00684	551 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ESA1	Q08649	445 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	GPM2	Q12008	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RPN6	Q12377	434 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ICT1	Q12385	394 aa		3.37	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	TFC1	P32367	649 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	PTM1	P32857	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ATO2	P32907	282 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MIX23	P38162	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SNM1	P40993	198 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	FMP32	P43557	207 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	CPD1	P53314	239 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RCF2	P53721	224 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
REE1	YJL217W	TDA1	Q03533	586 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SPC2	Q04969	178 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	FMP42	Q04991	504 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	GRS2	Q06817	618 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	TMS1	Q12116	473 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MSH5	Q12175	901 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ATP6	P00854	259 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SNF4	P12904	322 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ATR1	P13090	542 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	CCA1	P21269	546 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YCR099C	P25657	155 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	CPR3	P25719	182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	PPA2	P28239	310 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	AEP1	P32493	518 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	IES6	P32617	166 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YKL063C	P35725	167 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MAL32	P38158	584 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	AVT5	P38176	459 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YPC1	P38298	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YIL029C	P40538	142 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	GET1	P53192	235 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MAL12	P53341	584 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	GAS3	Q03655	524 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SNX41	Q04053	625 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	DYN3	Q04949	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RTT103	Q05543	409 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SEC10	Q06245	871 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	SNA4	Q07549	140 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RGT2	Q12300	763 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	HRT3	Q12347	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	EAF3	Q12432	401 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	CYC3	P06182	269 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	ERD1	P16151	362 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	APA2	P22108	325 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YCR043C	P25361	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MRPL6	P32904	214 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MRP21	P38175	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YHR035W	P38769	630 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	PFS1	P38872	237 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	MET30	P39014	640 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REE1	YJL217W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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