RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	POM33	Q12164	279 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YOR114W	Q12219	294 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ERG2	P32352	222 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	COY1	P34237	679 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	RPC25	P35718	212 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	POP8	P38208	133 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SPT8	P38915	602 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	OSW5	P40219	148 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	KEL2	P50090	882 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	DAD3	P69850	94 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	RRG8	Q06109	277 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CUR1	Q06469	252 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SUE1	Q06524	206 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	GPN3	Q06543	272 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ATP6	P00854	259 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	GPI12	P23797	304 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CSM1	P25651	190 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	HIS2	P38635	335 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YHL026C	P38740	315 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	AGP3	P43548	558 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	VPS60	Q03390	229 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TAF9	Q05027	157 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YOL019W	Q08157	551 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	REX3	Q12090	404 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ATG15	P25641	520 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SCM4	P32564	187 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CSG2	P35206	410 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.86	□□□□□ -2.27	not detected
YJL135W	YJL135W	YOR062C	P36025	268 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ASI3	P53983	676 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YPL039W	Q03080	316 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	MDY2	Q12285	212 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	UGA1	P17649	471 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ARN2	P38724	620 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	VPS45	P38932	577 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	AYR1	P40471	297 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	IBA57	P47158	497 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CPD1	P53314	239 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CAB4	P53332	305 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SLM2	P53955	656 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ECM18	Q04623	453 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	RAD10	P06838	210 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CCA1	P21269	546 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PEX3	P28795	441 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SFC1	P33303	322 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	HMT1	P38074	348 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YER135C	P40082	130 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YFR054C	P43622	192 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	GON7	P46984	123 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	NIF3	P53081	288 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PEX31	P53203	462 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YNL260C	P53846	198 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YNL050C	P53952	270 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SPO19	Q03029	223 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SDC1	Q03323	175 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SEC10	Q06245	871 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	BCP1	Q06338	283 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PPH21	P23594	369 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	TEM1	P38987	245 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SFH1	Q06168	426 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PER33	Q12144	273 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RAD3	P06839	778 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YSR3	P23501	404 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RNP1	P32385	249 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MAL32	P38158	584 aa		0.82	□□□□□ -2.28

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