RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W VMA9Q3E7B6 73 aa3.52□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ARG80P07249 177 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SSA3P09435 649 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YFL068WP0CX99 160 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YLL066W-AP0CY00 160 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YLL067W-AP0CY01 160 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W DAL80P26343 269 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ADE1P27616 306 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SSH4P32343 579 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YKL162CP36052 402 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YHL026CP38740 315 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W UIP3P39547 235 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W IDP2P41939 412 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PMT4P46971 762 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PKP2P53170 491 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PRM8P53174 237 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W CWC27Q02770 301 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YLR281CQ05863 155 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YLR173WQ06247 608 aa3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
HCA4YJL033W GRR1P24814 1151 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RNA14P25298 677 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W FAA1P30624 700 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
HCA4YJL033W YBR013CP38215 129 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ALG8P40351 577 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SNG1P46950 547 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W TAD2P47058 250 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ABM1P47146 123 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W NBP35P52920 328 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YGL159WP53110 370 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SGF73P53165 657 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ERV29P53337 310 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YNL234WP53857 426 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GIM3P53900 129 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RRN5Q02983 363 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SNO1Q03144 224 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W OST6Q03723 332 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YDR124WQ04608 324 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RRT8Q08219 342 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YOL131WQ08270 108 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YOR387CQ08910 206 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YLR046CQ12253 270 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W INP53Q12271 1107 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W NAM2P11325 894 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W IDP1P21954 428 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W CDC50P25656 391 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W BUB3P26449 341 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SUR1P33300 382 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W TKL2P33315 681 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W TMA19P35691 167 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SIP4P46954 829 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GTO1P48239 356 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ROG1P53118 685 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W NUP100Q02629 959 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SSK1Q07084 712 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W UAF30Q08747 228 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SNF8Q12483 233 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RMD5Q12508 421 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa3.5□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GAL80P04387 435 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RPB3P16370 318 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W FUN14P18411 198 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SNF6P18888 332 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RPB8P20436 146 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YCR043CP25361 127 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W HOM6P31116 359 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MRPL15P36523 253 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W APE3P37302 537 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MRP21P38175 177 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RCK1P38622 512 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W FAU1P40099 211 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W COA1P40452 197 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MEP2P41948 499 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W FRE4P53746 719 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MET31Q03081 177 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W BOP2Q06150 570 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RAD28Q12021 506 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W IRA1P18963 3092 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W KIN28P06242 306 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
HCA4YJL033W MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W URA6P15700 204 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YPK2P18961 677 aa3.49□□□□□ -1.85
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