RNA–Protein interactions for RNA: YHR181W

SVP26, Transcript of Integral membrane protein of the early Golgi apparatus and ER, yeast

Gene SVP26, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVP26	YHR181W	YKL070W	P36087	169 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	PHO89	P38361	574 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	RPE1	P46969	238 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	FMP33	P46998	180 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	PEX31	P53203	462 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YSR3	P23501	404 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YER188W	P40103	239 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	PIR5	P46999	287 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	MND1	P53102	219 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	LSB1	P53281	241 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YNL095C	P53932	642 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	CDC14	Q00684	551 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YPL039W	Q03080	316 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	SDC1	Q03323	175 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	SFH1	Q06168	426 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		2.25	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	ATG12	P38316	186 aa		2.25	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.25	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	PAN1	P32521	1480 aa		2.25	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.24	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YHI9	P38765	294 aa		2.24	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	MED6	P38782	295 aa		2.24	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	SER33	P40510	469 aa		2.24	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	SPP2	Q02521	185 aa		2.24	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	SEC10	Q06245	871 aa		2.24	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	CSG2	P35206	410 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	HMT1	P38074	348 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	ARN2	P38724	620 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YPL150W	Q12152	901 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	AGC1	Q12482	902 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	ISD11	Q6Q560	94 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	COS2	P0CX12	379 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	COS3	P0CX13	379 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	POF1	P25576	258 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	PEX3	P28795	441 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	PEX18	P38855	283 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	MRX5	P47007	382 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	ARV1	Q06541	321 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YOL019W	Q08157	551 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YOS9	Q99220	542 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SVP26	YHR181W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RRT12	P25381	491 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	COY1	P34237	679 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	HSM3	P38348	480 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	NBP35	P52920	328 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RGM1	Q00453	211 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	YMR166C	Q03829	368 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	CTS2	Q06350	511 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	PER33	Q12144	273 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	MNT4	P53745	580 aa		2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	SWS2	P53937	143 aa		2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	GMC2	Q06201	188 aa		2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	CDD1	Q06549	142 aa		2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	ATC1	Q04005	294 aa		2.19	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	YOR268C	Q08734	132 aa		2.19	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	SNF6	P18888	332 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	YHL049C	P38722	271 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	TIM21	P53220	239 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RAD10	P06838	210 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	CLB6	P32943	380 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	SHC1	P39000	512 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	COA1	P40452	197 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	TAD2	P47058	250 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	YJR146W	P47174	117 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	PLB3	Q08108	686 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	YPL247C	Q12523	523 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	OM45	P16547	393 aa		2.16	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	YHR045W	P38775	560 aa		2.16	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	AGX1	P43567	385 aa		2.16	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	KAP114	P53067	1004 aa		2.16	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	NIF3	P53081	288 aa		2.16	□□□□□ -2.06
SVP26	YHR181W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06

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