RNA–Protein interactions for RNA: YER180C-A

SLO1, Transcript of Protein interacting with Arl3p, yeast

Gene SLO1, Length 258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLO1	YER180C-A	QRI7	P43122	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SFH5	P47008	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YJL055W	P47044	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ASI2	P53895	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PGA1	P53896	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	NUP49	Q02199	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	AIM36	Q03798	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	NNT1	Q05874	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	TAZ1	Q06510	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	GAT3	Q07928	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	DYN1	P36022	4092 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	REP1	P03871	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	TPK3	P05986	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ATR1	P13090	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	AST1	P35183	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PHO90	P39535	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SNL1	P40548	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	EGT2	P42835	1041 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	LOH1	P47055	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ABM1	P47146	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YNL046W	P53956	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RSM23	Q01163	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	HOT1	Q03213	719 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RNH1	Q04740	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	FSH3	Q99369	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	MET3	P08536	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	DSF1	P0CX08	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SAM35	P14693	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	HNM1	P19807	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	CPR2	P23285	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	OAC1	P32332	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SUR1	P33300	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	MSS4	P38994	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ECM1	P39715	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YER121W	P40076	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YIR020C	P40575	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SWP82	P43554	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	NCA3	P46955	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PEF1	P53238	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YPL077C	Q02831	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YMR279C	Q03263	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SMP3	Q04174	516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	GMC1	Q04399	608 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YPR196W	Q06595	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	LOT6	Q07923	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PCL9	Q12477	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	COX5B	P00425	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YML003W	P0CF16	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	NAM2	P11325	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	STE18	P18852	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	DBF2	P22204	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	BOS1	P25385	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RPC34	P32910	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	NNK1	P36003	928 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	FAT1	P38225	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ECM8	P38246	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SLM4	P38247	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YBR138C	P38277	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PEX7	P39108	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PUG1	P40100	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RET2	P43621	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ERP6	P53198	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YMD8	Q03697	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	MRX8	Q05473	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	SNA4	Q07549	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	AIM6	Q07716	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	TAF3	Q12297	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	RTR2	Q12378	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ERP4	Q12450	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
SLO1	YER180C-A	MSI1	P13712	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	FAR1	P21268	830 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	APA2	P22108	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	ECT1	P33412	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	YPK3	P38070	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLO1	YER180C-A	FLX1	P40464	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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