RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C BNA7Q04066 261 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR387CQ04162 555 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SMP3Q04174 516 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DLT1Q04216 342 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HLR1Q04429 423 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GAL83Q04739 417 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR317WQ04893 1140 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SPR28Q04921 423 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ASM4Q05166 528 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RSA3Q05942 220 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR173WQ06247 608 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TPO3Q06451 622 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TAZ1Q06510 381 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MLC2Q06580 163 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR196WQ06595 470 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IPK1Q06667 281 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HRT1Q08273 121 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FIT3Q08907 204 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ACF2Q12168 779 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C WSC3Q12215 556 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PRS5Q12265 496 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TY1A-BLQ12266 440 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR126CQ12288 251 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL180WQ12301 547 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL114CQ12322 202 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HMS1Q12398 434 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ISA2Q12425 185 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ERP4Q12450 207 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ENA5Q12691 1091 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ADF1Q2V2Q1 113 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MHF1Q3E835 90 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YBL113CQ7M4S9 792 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MED11Q99278 115 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FSH3Q99369 266 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C VCX1Q99385 411 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HFA1P32874 2273 aa0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C POL2P21951 2222 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BRR2P32639 2163 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TIM9O74700 87 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data0.59□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C COX5BP00425 151 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SOD2P00447 233 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C REP1P03871 373 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C AAC1P04710 309 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL6BP05739 176 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS13P05756 151 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS31P05759 152 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HIS3P06633 220 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ARG80P07249 177 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SGA1P08019 549 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GCD1P09032 578 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NFT1P0CE68 1218 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DSF1P0CX08 502 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YNR073CP0CX09 502 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS23BP0CX30 145 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SPS100P13130 326 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL30P14120 105 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SAM35P14693 329 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ARO3P14843 370 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data0.59□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO7P18410 259 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SNF6P18888 332 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HNM1P19807 563 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SAG1P20840 650 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FPS1P23900 669 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DBP2P24783 546 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PCL1P24867 279 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IFM1P25038 676 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C STE50P25344 346 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GIT1P25346 518 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PET18P25362 215 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SED4P25365 1065 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RER1P25560 188 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YCL042WP25572 119 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C AHC2P25649 128 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL5P26321 297 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GAR1P28007 205 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C UBC8P28263 218 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TRR1P29509 319 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DEG1P31115 442 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PUP2P32379 260 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ARO4P32449 370 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC3P32457 520 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG24P32462 438 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NDC1P32500 655 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GLC7P32598 312 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU2P32612 120 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C AGA2P32781 87 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YME2P32843 850 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PEP12P32854 288 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CLB6P32943 380 aa0.59□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MDL1P33310 695 aa0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms