RNA–Protein interactions for RNA: YLR423C

ATG17, Transcript of Scaffold protein responsible for phagophore assembly site organization, yeast

Gene ATG17, Length 1,254 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG17	YLR423C	YAR1	P46683	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	YGL118C	P53132	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	YML018C	Q03730	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	CWP1	P28319	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	IMP1	P28627	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	AIM29	P36154	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	MRPS9	P38120	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	KRE29	P40026	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	YIL012W	P40551	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	YFL012W	P43580	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	MIC19	P43594	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	TPN1	P53099	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	YGR018C	P53211	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	TRM10	Q12400	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG17	YLR423C	FRM2	P37261	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YER184C	P39961	794 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	TIM21	P53220	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	ZIP1	P31111	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	BIG1	P38813	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	SHC1	P39000	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	RRG9	P40156	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	IME2	P32581	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	MRPL3	P36516	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	MRP21	P38175	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	SEN34	P39707	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YFL064C	P43540	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YJR012C	P47087	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	PET117	Q02771	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	VPS60	Q03390	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	ARV1	Q06541	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	SEO1	P39709	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	ASG7	P46993	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	IBA57	P47158	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	SEC10	Q06245	871 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	MBA1	P38300	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	ATG12	P38316	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	FMC1	P40491	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	AVT7	P40501	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	UFE1	P41834	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	COQ5	P49017	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	MRPL50	P53724	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	MNT4	P53745	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	CDC14	Q00684	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	RNH1	Q04740	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	CDC42	P19073	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	CAX4	P53223	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	MRS2	Q01926	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	SRL4	Q03085	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	MRX8	Q05473	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YOS9	Q99220	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG17	YLR423C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	YCR025C	P25352	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	PEX3	P28795	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	VPH2	P32341	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
ATG17	YLR423C	MID2	P36027	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	FRT2	P39734	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	LIF1	P53150	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	ECM11	Q04110	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	BOP2	Q06150	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	PAM18	Q07914	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	SRB4	P32569	687 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	MSN4	P33749	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG17	YLR423C	ECM19	Q06011	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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