RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	CDC23	P16522	626 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YSR3	P23501	404 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DOA4	P32571	926 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PDC2	P32896	925 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	KKQ8	P36004	724 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	THI2	P38141	450 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	IML3	P38265	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RTC2	P38279	296 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YHR122W	P38829	231 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SSO2	P39926	295 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YEL068C	P39977	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SWM2	P40342	146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	APQ12	P40532	138 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YFR020W	P43600	232 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	AIM25	P47140	327 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PMT5	P52867	743 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	EMC4	P53073	190 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RSM28	Q03430	361 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	NUP53	Q03790	475 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SNX41	Q04053	625 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	VBA1	Q04301	562 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RRN11	Q04712	507 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	GAS2	Q06135	555 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PER33	Q12144	273 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YOS9	Q99220	542 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PUT1	P09368	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ERD1	P16151	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	AAC3	P18238	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YCR061W	P25639	631 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	FUN26	P31381	517 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ATS1	P31386	333 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DAL3	P32459	195 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SKN1	P33336	771 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SRY1	P36007	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DTR1	P38125	572 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	NSG1	P38837	291 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CHL4	P38907	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	AIM2	P39721	246 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YJL068C	P40363	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	AZF1	P41696	914 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PRM10	P42946	383 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SWC4	P53201	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	HHO1	P53551	258 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PGA1	P53896	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ASI3	P53983	676 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MSC1	Q03104	513 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DCR2	Q05924	578 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	KEI1	Q06346	221 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SPC3	Q12133	184 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TPO4	Q12256	659 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	INP53	Q12271	1107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PDE1	P22434	369 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PAU2	P32612	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ECT1	P33412	323 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LAG1	P38703	411 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	COS8	P38723	381 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	HEM14	P40012	539 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	HIS6	P40545	261 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CAT5	P41735	233 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	IDS2	P46958	469 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LOH1	P47055	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TAD2	P47058	250 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	COS12	P53053	380 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DOC1	P53068	250 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SDT1	P53078	280 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SAY1	P53324	424 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RHO4	Q00246	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	REX4	Q08237	289 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 116 ms