RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	YHR045W	P38775	560 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	FET3	P38993	636 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SSO2	P39926	295 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	KRE29	P40026	464 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	AVT6	P40074	448 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YER188W	P40103	239 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	UBC13	P52490	153 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YDR286C	Q05530	114 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	DCR2	Q05924	578 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	APC9	Q12107	265 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	RAD7	P06779	565 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YCR025C	P25352	136 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	PET18	P25362	215 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SUR2	P38992	349 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	VAB2	P40003	282 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	COG3	P40094	801 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	COX16	P47081	118 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	BIO4	P53630	237 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	VPS20	Q04272	221 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	PGC1	Q08959	321 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YKL063C	P35725	167 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YHI9	P38765	294 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SPL2	P38839	148 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SEN34	P39707	275 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	GDS1	P41913	522 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	RPE1	P46969	238 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	COG7	P53195	279 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	VOA1	P53262	265 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	COS6	P53344	381 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	MRS2	Q01926	470 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	MGR3	Q04472	501 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YLL007C	Q07799	665 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SIA1	Q12212	622 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	EMC6	Q12431	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YJL135W	YJL135W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	AEP1	P32493	518 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	COT1	P32798	439 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	RPC37	P36121	282 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	DRE2	P36152	348 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PHO89	P38361	574 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
YJL135W	YJL135W	TDA11	P38854	504 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YIA6	P40556	373 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	LOH1	P47055	219 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	DSK2	P48510	373 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YPL077C	Q02831	240 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YMR209C	Q03648	457 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	DPP1	Q05521	289 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TAZ1	Q06510	381 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ASR1	Q06834	288 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ATG5	Q12380	294 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	AGC1	Q12482	902 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PAN1	P32521	1480 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	STF1	P01098	86 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TFS1	P14306	219 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	OPI1	P21957	404 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	KRE6	P32486	720 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SUA5	P32579	426 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YDR089W	P38966	869 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	FCY21	P40039	528 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	AVT7	P40501	490 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	PIR5	P46999	287 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YJL016W	P47072	561 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YJR146W	P47174	117 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	DAN1	P47178	298 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	GTO1	P48239	356 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	TPN1	P53099	579 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	ABZ2	Q03266	374 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	YML018C	Q03730	393 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	CTS2	Q06350	511 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YJL135W	YJL135W	VAC14	Q06708	880 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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