RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ARO10	Q06408	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	VPS36	Q06696	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MIM1	Q08176	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	HRT1	Q08273	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YCR051W	P25631	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	APL3	P38065	1025 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PSD1	P39006	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	MTW1	P39731	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	NAS2	P40555	220 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	IMA5	P40884	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	TAX4	P47030	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YJL055W	P47044	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	COX18	P53239	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RAD33	Q04231	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RRT8	Q08219	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SFM1	Q12314	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PDE2	P06776	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PPA2	P28239	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
SYF2	YGR129W	GPI18	P38211	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YBR096W	P38256	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YHR035W	P38769	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	FLX1	P40464	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	BNA2	P47125	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	DIA3	P52290	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	GEP7	P53171	287 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	MEP3	P53390	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RNH202	Q05635	350 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	EXO70	P19658	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	VPH2	P32341	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	NIC96	P34077	839 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	FIG1	P38224	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	FAT1	P38225	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	IST2	P38250	946 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	MSS11	Q03825	758 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SHE9	Q04172	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	IRC25	Q07951	179 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ULA1	Q12059	462 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	APC2	Q12440	853 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	MRX4	Q12467	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	MET3	P08536	511 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RHB1	P25378	209 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YBR063C	P38083	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ALP1	P38971	573 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SWD1	P39706	426 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SNO4	Q04902	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	HSP32	Q08992	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ATP6	P00854	259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	TPK2	P06245	380 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RAD7	P06779	565 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RPD3	P32561	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	IES6	P32617	166 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YCR041W	P37265	110 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RNT1	Q02555	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	BNA7	Q04066	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	NSL1	Q12143	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	PCL1	P24867	279 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	MIG1	P27705	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	ACH1	P32316	526 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	TOA1	P32773	286 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	NUF2	P33895	451 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	RCY1	P39531	840 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	YER184C	P39961	794 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	DML1	Q03652	475 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	FCY22	Q12119	530 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYF2	YGR129W	COX5B	P00425	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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