RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C ATG21Q02887 496 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HOT1Q03213 719 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C URC2Q04411 772 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SEI1Q06058 285 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ARV1Q06541 321 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOL024WQ08172 172 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOR376WQ08900 122 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YDL211CQ12121 372 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YLR126CQ12288 251 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PAR32Q12515 295 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOS9Q99220 542 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GDH1P07262 454 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RPC40P07703 335 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOL162WP0CF19 215 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ERD1P16151 362 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NCP1P16603 691 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ERD2P18414 219 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C FAR1P21268 830 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SEC62P21825 274 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RHB1P25378 209 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YCR102CP25608 368 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ASF2P32448 525 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HSP150P32478 413 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HIR2P32480 875 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CYS4P32582 507 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ECM8P38246 354 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YBR138CP38277 524 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C OM14P38325 134 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PEX18P38855 283 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C AST2P39945 430 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C COG3P40094 801 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YNL208WP40159 199 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PRE6P40303 254 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YRB2P40517 327 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PKP1P40530 394 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GCN20P43535 752 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C IRC6P43615 237 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C IMD4P50094 524 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SHE4P51534 789 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C LSG1P53145 640 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PRM8P53174 237 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MEP3P53390 489 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RHO5P53879 331 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RSN1Q03516 953 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SMP3Q04174 516 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ERB1Q04660 807 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PAL1Q05518 499 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DCR2Q05924 578 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YLR446WQ06204 433 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SYO1Q07395 620 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MDM32Q12171 622 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NFI1Q12216 726 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RIB3Q99258 208 aa1.98□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TPK3P05986 398 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CAR2P07991 424 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TFS1P14306 219 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SNF6P18888 332 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ERG8P24521 451 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RAD51P25454 400 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YCR100CP25606 316 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SNC1P31109 117 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ATS1P31386 333 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PUP2P32379 260 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PRP21P32524 280 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SSE2P32590 693 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TIM12P32830 109 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MDL1P33310 695 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ECM15P35195 104 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C JEN1P36035 616 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MTC4P38335 694 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YBR285WP38354 144 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RPS20P38701 121 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data1.97□□□□□ -2.09not detected
GCN4YEL009C RRP4P38792 359 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SBE22P38814 852 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PTH1P38876 190 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ALP1P38971 573 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RRG9P40156 214 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SOK1P40317 901 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SEC24P40482 926 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GVP36P40531 326 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PHB1P40961 287 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ECO1P43605 281 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YFR054CP43622 192 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RPE1P46969 238 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C EMC2P47133 292 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HMS2P47175 358 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C BAT2P47176 376 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PDR16P53860 351 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C COG5P53951 403 aa1.97□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SUR7P54003 302 aa1.97□□□□□ -2.09
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