RNA–Protein interactions for RNA: YDL033C

SLM3, Transcript of tRNA-specific 2-thiouridylase, yeastyeast

Gene SLM3, Length 1,254 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3YDL033C SCM4P32564 187 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C COS9P36034 407 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C AVT5P38176 459 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ALG3P38179 458 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data7.19□□□□□ -1.26not detected
SLM3YDL033C RPS20P38701 121 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C GND1P38720 489 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C LNP1P38878 278 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YIL165CP40446 119 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C GTS1P40956 396 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C CAT5P41735 233 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ALK1P43633 760 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C OCA2P53949 197 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SNO1Q03144 224 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C CCE1Q03702 353 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YOL073CQ08232 322 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C BSC6Q08280 497 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C HMS1Q12398 434 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C Q0142Q9ZZW4 58 aa7.19□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YPR096CO13587 100 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C AI3P03877 415 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C CDC9P04819 755 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C CDC21P06785 304 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C MTH1P35198 433 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SFK1P35735 353 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TCM62P38228 572 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PBP1P53297 722 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PAU12P53343 120 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C HST3P53687 447 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YNR062CP53748 327 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ARG5,6Q01217 863 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PLM2Q04383 521 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ELP6Q04868 273 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C DIC1Q06143 298 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YPR127WQ06494 345 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YLR036CQ07986 203 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PFA4Q12006 378 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C BSC1Q12140 328 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SRN2Q99176 213 aa7.18□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PRB1P09232 635 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C CDC34P14682 295 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C VMA16P23968 213 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C BUB3P26449 341 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TIP20P33891 701 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PAU24P38155 120 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TAT2P38967 592 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PKP2P53170 491 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RSM27P53305 110 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C FMP41P53889 259 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PUN1Q06991 263 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TMS1Q12116 473 aa7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C CAR2P07991 424 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PUT1P09368 476 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SEC12P11655 471 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SEC59P20048 519 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YSR3P23501 404 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C POF1P25576 258 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YIM1P28625 365 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C CTS1P29029 562 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C MSK1P32048 576 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C DOA4P32571 926 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SPT10P35208 640 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C EMC3P36039 253 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YBR071WP38243 211 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data7.16□□□□□ -1.26 RIP-Chip
SLM3YDL033C YEL073CP39974 107 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C PIG2P40187 538 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TOK1P40310 691 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C QRI7P43122 407 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C BUL1P48524 976 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C MUP1P50276 574 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C COS12P53053 380 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C ELA1P53861 379 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RSM10Q03201 203 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C OST6Q03723 332 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YDR387CQ04162 555 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TY1A-MR1Q04215 440 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C RNH202Q05635 350 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C KEI1Q06346 221 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C HDA2Q06629 674 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C GRC3Q07845 632 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C TY1A-BLQ12266 440 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C INP53Q12271 1107 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SKS1Q12505 502 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa7.16□□□□□ -1.26
SLM3YDL033C SEC22P22214 214 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.2 ms