RNA–Protein interactions for RNA: YDL007W

RPT2, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT2, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT2	YDL007W	GLN3	P18494	730 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	VMA16	P23968	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PTP1	P25044	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ERG4	P25340	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ADE1	P27616	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YIM1	P28625	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SUR1	P33300	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LOT5	P34234	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	BMT2	P38278	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RTT105	P40063	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RGI2	P40188	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ALG8	P40351	577 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	POG1	P40473	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CAT5	P41735	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LOH1	P47055	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	AMA1	P50082	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	COS12	P53053	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ASI3	P53983	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MEH1	Q02205	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CAC2	Q04199	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SEN15	Q04675	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RAD28	Q12021	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	INP53	Q12271	1107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	HMS1	Q12398	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PUT1	P09368	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CDC26	P14724	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MER1	P16523	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MRPL44	P19956	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	HOP1	P20050	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	AHC2	P25649	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MRP17	P28778	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	NTH1	P32356	751 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PMT1	P33775	817 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SOL2	P37262	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YHC3	P47040	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	IBA57	P47158	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PHB2	P50085	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PKP2	P53170	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SUN4	P53616	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YNR062C	P53748	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YSA1	Q01976	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PLM2	Q04383	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ELP6	Q04868	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SPC3	Q12133	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ZRC1	P20107	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MRPL9	P31334	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	HXT4	P32467	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SFK1	P35735	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	DTR1	P38125	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LDB7	P38210	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	VMA21	P41806	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	AGX1	P43567	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	GAT1	P43574	510 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	DAN1	P47178	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MUP1	P50276	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	HOL1	P53389	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MNT4	P53745	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SMA2	Q04658	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CIA1	Q05583	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	KEI1	Q06346	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	IPK1	Q06667	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LAS17	Q12446	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RRI1	Q12468	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YLR415C	O13578	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YPR096C	O13587	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	COX3	P00420	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CDC21	P06785	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YPK2	P18961	677 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SKN1	P33336	771 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MSN4	P33749	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MTH1	P35198	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PAU24	P38155	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YBR013C	P38215	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.7 ms