RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CBF1P17106 351 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W DCC1P25559 380 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CPR3P25719 182 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W MKK1P32490 508 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W NUP2P32499 720 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W RIB1P38066 345 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SLM1P40485 686 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YRB1P41920 201 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YDR209CQ03480 137 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W DCR2Q05924 578 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SPO77Q06134 477 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W VPS74Q06385 345 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YOR387CQ08910 206 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W NCB2Q92317 146 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W IZH4Q99393 312 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W ATP6P00854 259 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W MUD1P32605 298 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W PTR2P32901 601 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YHK8P38776 514 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YPT35P38815 214 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W MDM31P38880 579 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W VPS52P39904 641 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W THO1P40040 218 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W GLG2P47011 380 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W RTT101P47050 842 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W TAD2P47058 250 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W NUP116Q02630 1113 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YPL077CQ02831 240 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W ODC1Q03028 310 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W BNA5Q05979 453 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W ALE1Q08548 619 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YDL009CQ12210 107 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W LAG2Q92325 660 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W DET1Q99288 334 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W GPX2P38143 162 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YHR035WP38769 630 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W COX15P40086 486 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W DDI1P40087 428 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SFH5P47008 294 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W GWT1P47026 490 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W POP6P53218 158 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CPD1P53314 239 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W ZRG17P53735 605 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W HCH1P53834 153 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CCE1Q03702 353 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W GAT3Q07928 141 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YLR108CQ12259 485 aa4.43□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W AUS1Q08409 1394 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CAP2P13517 287 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W POX1P13711 748 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W TIR2P33890 251 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W EGD2P38879 174 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W DFG10P40526 253 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YCH1P42937 148 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W GIM5Q04493 163 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W FUS2Q05670 677 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SRO7Q12038 1033 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SNF8Q12483 233 aa4.42□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SAM2P19358 384 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W EXG1P23776 448 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data4.41□□□□□ -1.7not detected
YKR104WYKR104W KAR9P32526 644 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CSE1P33307 960 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YKL063CP35725 167 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W CHK1P38147 527 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W SMF2P38778 549 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W ERG28P40030 148 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YIL001WP40560 513 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W DSN1P40568 576 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W ABM1P47146 123 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YBL111CQ3E7Y5 667 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W HKR1P41809 1802 aa4.41□□□□□ -1.7
YKR104WYKR104W YBR121C-AP0C5L4 52 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W AMD1P15274 810 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W NOP1P15646 327 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W YMR31P19955 123 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W ATP7P30902 174 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W SDS24P38314 527 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W PRS2P38620 318 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W SEC72P39742 193 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W YNL194CP40169 301 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W IDP2P41939 412 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W IKS1P47042 667 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W SWC4P53201 476 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W VBA1Q04301 562 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W YPL199CQ08954 240 aa4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
YKR104WYKR104W HTB1P02293 131 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 92.3 ms