RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	OAC1	P32332	324 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	TRS65	P32893	560 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SLC1	P33333	303 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MSN4	P33749	630 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MDM31	P38880	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MLH1	P38920	769 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RTT105	P40063	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	LAS21	P40367	830 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YIL152W	P40455	235 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CFD1	P40558	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	TRM9	P49957	279 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SHE4	P51534	789 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CDH1	P53197	566 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MTQ1	P53944	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NCE101	Q02820	53 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	DCR2	Q05924	578 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	DCI1	Q08558	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	UIP4	Q08926	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	HSP42	Q12329	375 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PCL9	Q12477	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NKP1	Q12493	238 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	QCR7	P00128	127 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SNF6	P18888	332 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CLB2	P24869	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NIC96	P34077	839 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	JEN1	P36035	616 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ECM4	P36156	370 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YBR139W	P38109	508 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SBE22	P38814	852 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	IRC7	P43623	340 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NIT2	P47016	307 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YGR067C	P53243	804 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	GEP3	Q08622	556 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SIA1	Q12212	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	IES3	Q12345	250 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SET6	Q12529	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
CPR4	YCR069W	HSP30	P25619	332 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PTR2	P32901	601 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YKL071W	P36086	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YPK3	P38070	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YBR063C	P38083	404 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	LEU5	P38702	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ANS1	P38832	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NSG1	P38837	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
CPR4	YCR069W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SOK1	P40317	901 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AIM20	P40451	204 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	HIS6	P40545	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CUP9	P41817	306 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SPG5	P42933	373 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SNO3	P43544	222 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MEP3	P53390	489 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	COS1	P53822	381 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ARV1	Q06541	321 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CRT10	Q08226	957 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AKR2	Q12013	749 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MCP1	Q12106	302 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MET17	P06106	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SEC62	P21825	274 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	EHD3	P28817	500 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YHR035W	P38769	630 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CHL4	P38907	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	IRC6	P43615	237 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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