RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	SWM2	P40342	146 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SSU1	P41930	458 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	IDS2	P46958	469 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	STE24	P47154	453 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ROG1	P53118	685 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	EFM6	P53970	246 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CDC14	Q00684	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ICL2	Q12031	575 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AFI1	Q99222	893 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ISN1	Q99312	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YIH1	P25637	258 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	NAM9	P27929	486 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	GAC1	P28006	793 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
POP4	YBR257W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SRY1	P36007	326 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MRPL36	P36531	177 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AIM2	P39721	246 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YIL169C	P40442	995 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PKP1	P40530	394 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CDC1	P40986	491 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YJR030C	P47101	745 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AIM24	P47127	394 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PMT5	P52867	743 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TIM13	P53299	105 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	IRC15	Q02733	499 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ARL3	Q02804	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ATG21	Q02887	496 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PNG1	Q02890	363 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ODC1	Q03028	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	GPN3	Q06543	272 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PLB3	Q08108	686 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	DDC1	Q08949	612 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TRM8	Q12009	286 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	BSC1	Q12140	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MRX4	Q12467	430 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YOS9	Q99220	542 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CBP1	P07252	654 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AAC3	P18238	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RER1	P25560	188 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LDS1	P31379	325 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MCM10	P32354	571 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ATP11	P32453	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SIP1	P32578	815 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SLC1	P33333	303 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CPR5	P35176	225 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YKL162C	P36052	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SCO2	P38072	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YHR035W	P38769	630 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PAN6	P40459	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	BNA6	P43619	295 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RPE1	P46969	238 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	COS10	P52924	374 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	AAT1	Q01802	451 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MDM30	Q05930	598 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	SSK1	Q07084	712 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ATG41	Q12048	136 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	NMD4	Q12129	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	CCH1	P50077	2039 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ERD2	P18414	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	PPH22	P23595	377 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ACP1	P32463	125 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	KRE6	P32486	720 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ECM25	P32525	599 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	VAM7	P32912	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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