RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	DAL2	P25335	343 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ERV1	P27882	189 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	AVT5	P38176	459 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YBR137W	P38276	179 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	GOS1	P38736	223 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	CKB2	P38930	258 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YAR028W	P39548	234 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ECM27	P47144	725 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	BUD32	P53323	261 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	HXT17	P53631	564 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YLR460C	P54007	376 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	HXT15	P54854	567 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	NUP49	Q02199	472 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	GAS2	Q06135	555 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	NKP2	Q06162	153 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TPO3	Q06451	622 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	AIM6	Q07716	390 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	IZH3	Q07959	543 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	JLP1	Q12358	412 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RKM5	Q12367	367 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PRM4	Q12498	284 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PUT1	P09368	476 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YCR023C	P25351	611 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	COQ2	P32378	372 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	UTR4	P32626	227 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SSS1	P35179	80 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YKL075C	P36083	450 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CBP4	P37267	147 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	VPS52	P39904	641 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SHO1	P40073	367 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	GCV1	P48015	400 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TRM9	P49957	279 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	COS10	P52924	374 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YNL260C	P53846	198 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ASI2	P53895	289 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SPP2	Q02521	185 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SHR3	Q02774	210 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YDR132C	Q03900	495 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PPN1	Q04119	674 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	APC4	Q04601	652 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	HOF1	Q05080	669 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	MED7	Q08278	222 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	AAD15	Q08361	143 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	THI21	Q08975	551 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RKI1	Q12189	258 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TRM11	Q12463	433 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YOR111W	Q99210	232 aa		5.15	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	DNF2	Q12675	1612 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RSF2	P46974	1380 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	NUC1	P08466	329 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PTC6	P25646	442 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	STE14	P32584	239 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ADD66	P36040	267 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YKL162C	P36052	402 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CST26	P38226	397 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ERG7	P38604	731 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ARP1	P38696	384 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PFS1	P38872	237 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.14	□□□□□ -1.59	not detected
VBA1	YMR088C	PAC2	P39937	518 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	IKS1	P47042	667 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CTF18	P49956	741 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TPN1	P53099	579 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	MRPS35	P53292	345 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.14	□□□□□ -1.59	RIP-Chip
VBA1	YMR088C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	APS2	Q00381	147 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	STD1	Q02794	444 aa		5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YFL054C	P43549	646 aa		5.13	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19 ms