RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W GPX1P36014 167 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W FMP23P38231 175 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MKC7P53379 596 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MNT4P53745 580 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MRPL1Q04599 285 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W COQ10Q08058 207 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RDR1Q08904 546 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W BTS1Q12051 335 aa8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RPB8P20436 146 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W NUP1P20676 1076 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SCO1P23833 295 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W CLB2P24869 491 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SBA1P28707 216 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W GPX2P38143 162 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MAL32P38158 584 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YHR180WP38868 163 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W NVJ1P38881 321 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YJL193WP39542 402 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W JLP2P40206 208 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W PFS2P42841 465 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MAL12P53341 584 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RRN9P53437 365 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RCF1Q03713 159 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W TAZ1Q06510 381 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RAX1Q08760 435 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W ACF2Q12168 779 aa8.01□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SEC12P11655 471 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W FPS1P23900 669 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W GIT1P25346 518 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data8□□□□□ -1.13not detected
DDI1YER143W TPO5P36029 618 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W PKP1P40530 394 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W HIS6P40545 261 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W IRC6P43615 237 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W GPI17Q04080 534 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MGR3Q04472 501 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W HRT1Q08273 121 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YPL191CQ08930 360 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MSH5Q12175 901 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W WTM2Q12206 467 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YOR343CQ12484 108 aa8□□□□□ -1.13
DDI1YER143W LDB16P25587 256 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W EHD3P28817 500 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SLC1P33333 303 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W ECT1P33412 323 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data7.99□□□□□ -1.13not detected
DDI1YER143W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W OM14P38325 134 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YER158CP40095 573 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W NAS2P40555 220 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RPE1P46969 238 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W PGU1P47180 361 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W CPR8P53728 308 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RSM10Q03201 203 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SNX41Q04053 625 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W BUR2Q05949 395 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YOL114CQ12322 202 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W LSO1Q3E827 93 aa7.99□□□□□ -1.13
DDI1YER143W PRE7P23724 241 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RAD51P25454 400 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MTC2P34246 357 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W DTR1P38125 572 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W PPT1P53043 513 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W FDC1Q03034 503 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W PFA5Q03289 374 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SWM1Q12379 170 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa7.98□□□□□ -1.13
DDI1YER143W KIN28P06242 306 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W GAS1P22146 559 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W AIM17P23180 465 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W HIS7P33734 552 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W THI2P38141 450 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MLH1P38920 769 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W FET3P38993 636 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YER010CP40011 234 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W SER3P40054 469 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W GDS1P41913 522 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W IKS1P47042 667 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W LYS5P50113 272 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YDR249CQ03787 373 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W GIS1Q03833 894 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W COX20Q04935 205 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W IPK1Q06667 281 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W MED2Q12124 431 aa7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
DDI1YER143W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W NFT1P0CE68 1218 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62 ms