RNA–Protein interactions for RNA: YDR289C

RTT103, Transcript of Protein involved in transcription termination by RNA polymerase II, yeast

Gene RTT103, Length 1,230 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT103	YDR289C	RPB5	P20434	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
RTT103	YDR289C	YFR057W	P43625	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PBA1	Q05778	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PRB1	P09232	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SPS100	P13130	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	INO2	P26798	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	ZIP1	P31111	875 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	CHD1	P32657	1468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MCH2	P36032	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MOB2	P43563	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	TAD2	P47058	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	PGA2	P53903	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	OST6	Q03723	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	FSH2	Q05015	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT103	YDR289C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	GDS1	P41913	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	OTU1	P43558	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	AIM23	P47015	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	SUR7	P54003	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	PRM4	Q12498	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	ARG80	P07249	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	CBS2	P14905	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	LDS1	P31379	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	DEP1	P31385	405 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	PDC2	P32896	925 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	CSE1	P33307	960 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	PEX22	P39718	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	EGT2	P42835	1041 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	TIS11	P47977	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	UBC13	P52490	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	VBA1	Q04301	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	GTO3	Q04806	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	TAF10	Q12030	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	JID1	Q12350	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	TFC7	Q12415	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	GIS3	Q12418	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	TFS1	P14306	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	CPR3	P25719	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	URA10	P30402	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	PMT2	P31382	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	CSE2	P33308	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YBL059W	P34224	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YPC1	P38298	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	DDI1	P40087	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	BIR1	P47134	954 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	CRH1	P53301	507 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	SLT2	Q00772	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	ATP16	Q12165	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	MSH5	Q12175	901 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	LDB7	P38210	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	GIM3	P53900	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	MFG1	Q07684	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	IZH2	Q12442	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	MHP1	P43638	1398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	GIT1	P25346	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	PPA2	P28239	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	MRPL6	P32904	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	SIP3	P38717	1229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	PAN6	P40459	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	HIT1	P46973	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	BNS1	P50084	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	KTR6	P54070	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	KRE28	Q04431	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	CTR3	Q06686	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	IRC25	Q07951	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	ERV2	Q12284	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	SFM1	Q12314	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTT103	YDR289C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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