RNA–Protein interactions for RNA: YBR267W

REI1, Transcript of Cytoplasmic pre-60S factor, yeast

Gene REI1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REI1	YBR267W	CTF8	P38877	133 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RRG9	P40156	214 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	XBP1	P40489	647 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	STB1	P42845	420 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ECO1	P43605	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RET2	P43621	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	MNN5	P46982	586 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	BIT61	P47041	543 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YJL055W	P47044	245 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YGR067C	P53243	804 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YLR460C	P54007	376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	REC102	Q02721	264 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ATG21	Q02887	496 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	PFA5	Q03289	374 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	MAK3	Q03503	176 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RIM13	Q03792	727 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	GRX3	Q03835	250 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	CRR1	Q05790	422 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ARO10	Q06408	635 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RCN2	Q12044	265 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	BAG7	Q12128	409 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	NFI1	Q12216	726 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	TMA17	Q12513	150 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SIR3	P06701	978 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	STE12	P13574	688 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	STP22	P25604	385 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ARO7	P32178	256 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RPD3	P32561	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	VPS51	P36116	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YKR073C	P36153	106 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SBE22	P38814	852 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	TRR2	P38816	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	DDI1	P40087	428 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SSY5	P47002	699 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	HMS2	P47175	358 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	GPG1	P53130	126 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YGR168C	P53293	376 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SKS1	Q12505	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SFG1	Q12507	346 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	TFS1	P14306	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	GIT1	P25346	518 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	PBN1	P25580	416 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	OAC1	P32332	324 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SRL3	P36167	246 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	GPX2	P38143	162 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	FMP23	P38231	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
REI1	YBR267W	YJL068C	P40363	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	MET28	P40573	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SNO3	P43544	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YJR096W	P47137	282 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RHO4	Q00246	291 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RCF1	Q03713	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	PLM2	Q04383	521 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SMA2	Q04658	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RNH1	Q04740	348 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RNH202	Q05635	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	ATG33	Q06485	197 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	VPS36	Q06696	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SIA1	Q12212	622 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	MTR10	Q99189	972 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	MET2	P08465	486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	HMG1	P12683	1054 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
REI1	YBR267W	YCK1	P23291	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	MDM31	P38880	579 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	RCY1	P39531	840 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	CIN1	P40987	1014 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REI1	YBR267W	SNM1	P40993	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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