RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	IKI1	P38874	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YJL206C	P39529	758 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CFD1	P40558	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MPS3	P47069	682 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TAH11	P47112	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	UFD1	P53044	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TIM13	P53299	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YNL143C	P53908	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YNL095C	P53932	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	NUP100	Q02629	959 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CDA2	Q06703	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	APC9	Q12107	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RGS2	Q99188	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	STF1	P01098	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	URA6	P15700	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RBK1	P25332	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	DCC1	P25559	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	GID7	P25569	745 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	UBC8	P28263	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RNP1	P32385	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	LST4	P34239	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YBR241C	P38142	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ERV46	P39727	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YGR201C	P42936	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SNN1	P48232	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YGR017W	P53210	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MRPL22	P53881	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SLM2	P53955	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	EFM6	P53970	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YAT1	P80235	687 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ATG21	Q02887	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ESA1	Q08649	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	COX17	Q12287	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SWM1	Q12379	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YLR302C	O13544	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	COX3	P00420	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SUC2	P00724	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CDC7	P06243	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PRE4	P30657	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ECT1	P33412	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	UTH1	P36135	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	AVT5	P38176	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	IPT1	P38954	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YIL166C	P40445	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PMT4	P46971	762 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CLD1	P53264	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SAM50	P53969	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	REG1	Q00816	1014 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SMA2	Q04658	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YET3	Q07451	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TGL5	Q12043	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RBD2	Q12270	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SFM1	Q12314	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YLR415C	O13578	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CKA1	P15790	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CTS1	P29029	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ARO7	P32178	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MTC7	P32633	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	IST2	P38250	946 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	IML3	P38265	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	FTH1	P38310	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TAE1	P38340	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CYC2	P38909	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YNL195C	P40168	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	GLC8	P41818	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BIT61	P47041	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YJR056C	P47115	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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