RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B NHX1Q04121 633 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TRI1Q05024 226 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B BCH1Q05029 724 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B THI7Q05998 598 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG39Q06159 398 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ARR2Q06597 130 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD34Q06665 692 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YDL086WQ07505 273 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ETT1Q08421 412 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B GPB1Q08886 897 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NIP7Q08962 181 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B JLP1Q12358 412 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B IZH2Q12442 317 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B BI3Q9ZZW7 517 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC8P00572 216 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MET3P08536 511 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPB5P20434 215 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPA135P22138 1203 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TRX1P22217 103 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD57P25301 460 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPC19P28000 142 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ARO2P28777 376 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B OCH1P31755 480 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ARP2P32381 391 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RIM1P32445 135 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B HYM1P32464 399 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PTM1P32857 523 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PDC2P32896 925 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NIP100P33420 868 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RRP1P35178 278 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B THI80P35202 319 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B COS9P36034 407 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CBP4P37267 147 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ADE17P38009 592 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MRP21P38175 177 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS41P38959 992 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B COG3P40094 801 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ARG2P40360 574 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B QDR1P40475 563 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SYG1P40528 902 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B HXT9P40885 567 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL213WP40896 331 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SNM1P40993 198 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CIR1P42940 261 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B BIT61P47041 543 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PET130P47065 347 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS12P48589 143 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YGL114WP53134 725 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TOS8P53147 276 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CPR6P53691 371 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B FAR11P53917 953 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B UBP2Q01476 1272 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RMI1Q02685 241 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SWP1Q02795 286 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CTL1Q03220 320 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B EKI1Q03764 534 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR179W-AQ03983 463 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B UTP15Q04305 513 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RSA3Q05942 220 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR407WQ06070 228 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR196WQ06595 470 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MHR1Q06630 226 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SWA2Q06677 668 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NRT1Q08485 598 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B FDH1Q08911 376 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SLP1Q12232 587 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR029WQ12243 111 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG34Q12292 412 aa0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data0.47□□□□□ -2.33not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS17AP02407 136 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B REP2P03872 296 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS17BP14127 136 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NMT1P14743 455 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B DDR48P18899 430 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CNA1P23287 553 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B HYP2P23301 157 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B DPB2P24482 689 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B GIT1P25346 518 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TRX3P25372 127 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-CP25383 438 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS2P25443 254 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B DMC1P25453 334 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YCL068CP25593 260 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR061WP25639 631 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B HEM3P28789 327 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PUP2P32379 260 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CAT2P32796 670 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CNS1P33313 385 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ANR2P36090 516 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B BAP2P38084 609 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ECM31P38122 312 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SRO77P38163 1010 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YBL081WP38180 368 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B FAT1P38225 669 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG14P38242 237 aa0.47□□□□□ -2.33
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