RNA–Protein interactions for RNA: YLR263W

RED1, Transcript of Protein component of the synaptonemal complex axial elements, yeast

Gene RED1, Length 2,484 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RED1	YLR263W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	KAR9	P32526	644 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SPO23	P33757	523 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RPC37	P36121	282 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	AVT5	P38176	459 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YHR035W	P38769	630 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YHR182W	P38870	785 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PFS1	P38872	237 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MET30	P39014	640 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PMT4	P46971	762 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MST27	P53176	234 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SUR7	P54003	302 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	TRM82	Q03774	444 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	GTO3	Q04806	366 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	FRE8	Q12209	686 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	FUN26	P31381	517 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ZRT1	P32804	376 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YKL187C	P34231	750 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MCH2	P36032	473 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YPC1	P38298	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YER184C	P39961	794 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	LCB3	P47013	409 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	CDH1	P53197	566 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	NUP116	Q02630	1113 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YMR027W	Q04371	470 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YOS9	Q99220	542 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RBK1	P25332	333 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PBN1	P25580	416 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PMT2	P31382	759 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	AGA1	P32323	725 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MRM2	P53123	320 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	GOR1	P53839	350 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SLT2	Q00772	484 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SPO77	Q06134	477 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ASR1	Q06834	288 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	DSE3	Q08729	430 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	DDC1	Q08949	612 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	TAF10	Q12030	206 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MCT1	Q12283	360 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YCR043C	P25361	127 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MRX3	P38172	270 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YBP1	P38315	674 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RPH1	P39956	796 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YAT2	P40017	923 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	HOC1	P47124	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MTM1	P53320	366 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	IBD2	P53892	351 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SCS7	Q03529	384 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	TAZ1	Q06510	381 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	DAL82	P21705	255 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	POF1	P25576	258 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	EHD3	P28817	500 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	NAT2	P37293	288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YIL169C	P40442	995 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	UBC13	P52490	153 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	GIM3	P53900	129 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SNX41	Q04053	625 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	LOA1	Q06508	300 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YDL199C	Q12407	687 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	TRP1	P00912	224 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ZRC1	P20107	442 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	CPR3	P25719	182 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MEI5	P32489	222 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	NUP2	P32499	720 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PEX2	P32800	271 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YKL071W	P36086	256 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RIB1	P38066	345 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MTC6	P38849	526 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	FHL1	P39521	936 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	XBP1	P40489	647 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	RPC17	P47076	161 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	VHT1	P53241	593 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YDL114W	Q07530	308 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	MFG1	Q07684	458 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	TMS1	Q12116	473 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RED1	YLR263W	ERP3	Q12403	225 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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