RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	PRM9	P39551	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	HIT1	P46973	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	AIM24	P47127	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	EAF6	P47128	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YIP1	P53039	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	NAT4	Q04751	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	DIC1	Q06143	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SGT1	Q08446	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RAX1	Q08760	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SLM3	Q12093	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	GET4	Q12125	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	COX2	P00410	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SPO12	P17123	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MRPL8	P22353	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YCR007C	P25354	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RSM22	P36056	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SHO1	P40073	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	BET5	Q03630	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ERP3	Q12403	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	JIP3	O13555	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	HEM2	P05373	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YPK2	P18961	677 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	EXO70	P19658	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RRT12	P25381	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ZIP1	P31111	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SKT5	P34226	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YKL097C	P34245	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	AIM29	P36154	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	BIG1	P38813	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YAR1	P46683	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	NAS6	P50086	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	TAF6	P53040	516 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SLD5	Q03406	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	HER2	Q03557	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	DAP1	Q12091	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	DAL82	P21705	255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	LSB5	P25369	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	VAM7	P32912	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	TDA11	P38854	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	FAA2	P39518	744 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	TOS2	P50078	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ORT1	Q12375	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SET6	Q12529	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RBK1	P25332	333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	PBN1	P25580	416 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	PHD1	P36093	366 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	LDB7	P38210	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	AZF1	P41696	914 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	BIO4	P53630	237 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	FRE4	P53746	719 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
YKR104W	YKR104W	NUP100	Q02629	959 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	YOP1	Q12402	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	PMD1	P32634	1753 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RAD1	P06777	1100 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	GLN3	P18494	730 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	ZRC1	P20107	442 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	UTR1	P21373	530 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	ACB1	P31787	87 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	FRE2	P36033	711 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	COA1	P40452	197 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR104W	YKR104W	AGP3	P43548	558 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71 ms