RNA–Protein interactions for RNA: YHR196W

UTP9, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP9, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP9	YHR196W	CAC2	Q04199	468 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	HSP31	Q04432	237 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RAD34	Q06665	692 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	THP1	Q08231	455 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPN6	Q12377	434 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	PET54	P10834	293 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	SNF3	P10870	884 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.2	□□□□□ -1.58	not detected
UTP9	YHR196W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPP1	P38786	293 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TDA11	P38854	504 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	FMP52	P40008	231 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	VEL1	P53058	206 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YDR209C	Q03480	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TRM82	Q03774	444 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	BCH1	Q05029	724 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	LDS2	Q08218	356 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	ALE1	Q08548	619 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YPQ1	Q12010	308 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	FCY22	Q12119	530 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	BBP1	Q12365	385 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YCR102C	P25608	368 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	MRPL6	P32904	214 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YBP1	P38315	674 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	NBP35	P52920	328 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	VPS62	P53285	467 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	COS6	P53344	381 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RSM23	Q01163	450 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	ABF2	Q02486	183 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YPL077C	Q02831	240 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YMR187C	Q03236	431 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	VBA1	Q04301	562 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YPR127W	Q06494	345 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YDL057W	Q07379	328 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YNG1	Q08465	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	GDA1	P32621	518 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	AIM26	P32858	118 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	CUE1	P38428	203 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	PMT6	P42934	759 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YGR201C	P42936	225 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YJR030C	P47101	745 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YJR079W	P47126	109 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TIS11	P47977	285 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	UBP8	P50102	471 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YNL092W	P53934	400 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	GIP3	Q03016	1276 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	MED7	Q08278	222 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YDR018C	Q12185	396 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-C	P25384	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	CHS2	P14180	963 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	CPT1	P17898	393 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	BDH2	P39713	417 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	YFH7	P43591	353 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	IBD2	P53892	351 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	DLT1	Q04216	342 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	LCB4	Q12246	624 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	IMA3	P0CW40	589 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	IMA4	P0CW41	589 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UTP9	YHR196W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58

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