RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	SDS22	P36047	338 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	RRF1	P38771	230 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	HXT9	P40885	567 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	ECM27	P47144	725 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	YGR266W	P53326	701 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	YDR541C	Q03049	344 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	RRN11	Q04712	507 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	YOL036W	Q08206	761 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	YDL211C	Q12121	372 aa		10.84	□□□□□ -0.67
YSC84	YHR016C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YMC1	P32331	307 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	DOA4	P32571	926 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	ECT1	P33412	323 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	FMO1	P38866	432 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YNL195C	P40168	261 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	VOA1	P53262	265 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	HPF1	Q05164	967 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SSK1	Q07084	712 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	FRE3	Q08905	711 aa		10.83	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SFC1	P33303	322 aa		10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	OMA1	P36163	345 aa		10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	ECM34	P38728	170 aa		10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	BNA6	P43619	295 aa		10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	APS3	P47064	194 aa		10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	DOC1	P53068	250 aa		10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SNO2	P53823	222 aa		10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	GCN4	P03069	281 aa		10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	KIN28	P06242	306 aa		10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YCL002C	P25565	263 aa		10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	APL3	P38065	1025 aa		10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YHR122W	P38829	231 aa		10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	ATP14	Q12349	124 aa		10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	APC2	Q12440	853 aa		10.81	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YEF1	P32622	495 aa		10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	ICE2	P40499	491 aa		10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	MTL1	P53214	551 aa		10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	CWC24	P53769	259 aa		10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	SPC19	Q03954	165 aa		10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	OPI10	Q08202	246 aa		10.8	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	DSF1	P0CX08	502 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YNR073C	P0CX09	502 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	BAR1	P12630	587 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	PDR3	P33200	976 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	GEP4	P38812	185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.79	□□□□□ -0.68	not detected
YSC84	YHR016C	SDP1	P40479	209 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	TIR3	P40552	269 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	PMT6	P42934	759 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	AIM25	P47140	327 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	REC102	Q02721	264 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	PRM15	Q03262	622 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YML096W	Q04489	525 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	INP53	Q12271	1107 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	PSF1	Q12488	208 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		10.79	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	UTR1	P21373	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	HCM1	P25364	564 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	PAU2	P32612	120 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	VPS17	P32913	551 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	MTH1	P35198	433 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.78	□□□□□ -0.68	not detected
YSC84	YHR016C	FMP52	P40008	231 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	IDS2	P46958	469 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	MDE1	P47095	244 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	GNP1	P48813	663 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	UBC12	P52491	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	POP6	P53218	158 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	NIS1	P53939	407 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	RSM28	Q03430	361 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	KEI1	Q06346	221 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	FEX1	Q08913	375 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	HAP4	P14064	554 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	AAC3	P18238	307 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	BUB3	P26449	341 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	ACB1	P31787	87 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	RML2	P32611	393 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	OAR1	P35731	278 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	HXT5	P38695	592 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	BAP3	P41815	604 aa		10.77	□□□□□ -0.68
YSC84	YHR016C	GPG1	P53130	126 aa		10.77	□□□□□ -0.68

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