RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	SLZ1	P40167	298 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SIP18	P50263	79 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	TYW3	P53177	273 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MAL13	P53338	473 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SED1	Q01589	338 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MRP51	Q02950	344 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	CRT10	Q08226	957 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YOL131W	Q08270	108 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YPR202W	Q08993	238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SNF8	Q12483	233 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MHF1	Q3E835	90 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SPO7	P18410	259 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SWH1	P35845	1188 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	FRE2	P36033	711 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	ECM34	P38728	170 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YER084W	P40057	128 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	PRM15	Q03262	622 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YKU80	Q04437	629 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MED2	Q12124	431 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SPE4	Q12455	300 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	CDC34	P14682	295 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YBL029W	P38201	376 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	GAB1	P41733	394 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	PEF1	P53238	335 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MTQ1	P53944	314 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RIM9	Q04734	239 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YDL109C	Q12103	647 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YOR214C	Q12282	236 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RNH203	Q12338	110 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YPR071W	Q12346	211 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MSI1	P13712	422 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RPO26	P20435	155 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RAD14	P28519	371 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MNS1	P32906	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	VPS41	P38959	992 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	PIG2	P40187	538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	HXT9	P40885	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	EXG2	P52911	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	COS6	P53344	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	HXT11	P54862	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SCS7	Q03529	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	TVP15	Q03860	143 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YEH2	Q07950	538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	UGA1	P17649	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	PTC1	P35182	281 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YER121W	P40076	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	POP1	P41812	875 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	CHA4	P43634	648 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	IMA1	P53051	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YIP4	P53093	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MTM1	P53320	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	IRC19	Q07843	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RAP1	P11938	827 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	ERD2	P18414	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
SYF2	YGR129W	VMA11	P32842	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	HCS1	P34243	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	ICS2	P38284	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	TOS2	P50078	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SNF12	P53628	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	FMN1	Q03778	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	ARV1	Q06541	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	NDL1	Q06568	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SNA4	Q07549	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	CSI2	Q08054	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SGT1	Q08446	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	DCI1	Q08558	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	BTS1	Q12051	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	SAS5	Q99314	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	PUT2	P07275	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	CLB3	P24870	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	ROT2	P38138	954 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	TSC10	P38342	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	LAS21	P40367	830 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF2	YGR129W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected

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