RNA–Protein interactions for RNA: YOR317W

FAA1, Transcript of Long chain fatty acyl-CoA synthetase, yeast

Gene FAA1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAA1	YOR317W	TSR4	P25040	408 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	NNF1	P47149	201 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	DIT2	P21595	489 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	CAT8	P39113	1433 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	BDF1	P35817	686 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	RAM2	P29703	316 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	ERP2	P39704	215 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	BIM1	P40013	344 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	YFR006W	P43590	535 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	DNF3	Q12674	1656 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	ATG32	P40458	529 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	TLG1	Q03322	224 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	NFU1	P32860	256 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	PSK2	Q08217	1101 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAA1	YOR317W	DNM1	P54861	757 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	IPL1	P38991	367 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	TGL3	P40308	642 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	HOS4	P40480	1083 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	GRX3	Q03835	250 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	YMR196W	Q04336	1088 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	CPS1	P27614	576 aa		5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	MEH1	Q02205	184 aa		5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	HAT1	Q12341	374 aa		5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	SEC20	P28791	383 aa		5	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	ERG12	P07277	443 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	CIT2	P08679	460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	BIO2	P32451	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	GRX4	P32642	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	IES2	P40154	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	YJL007C	P47080	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	ALG12	P53730	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	COG4	Q06096	861 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
FAA1	YOR317W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	TTI1	P36097	1038 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	BNR1	P40450	1375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	QCR6	P00127	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	ATE1	P16639	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	PPG1	P32838	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	ERP4	Q12450	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	USO1	P25386	1790 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FAA1	YOR317W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	YML083C	Q04526	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	NSE3	Q05541	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	IOC3	P43596	787 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	NKP1	Q12493	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	KAR1	P11927	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	FUI1	P38196	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	PPX1	P38698	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	OPI1	P21957	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	MAL31	P38156	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	ENV11	P53246	860 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	PKH1	Q03407	766 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	ENT2	Q05785	613 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	SRB8	P25648	1427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	MRM1	P25270	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	SEC6	P32844	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	SVF1	Q05515	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	IES1	P43579	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	PUP1	P25043	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAA1	YOR317W	BLI1	P35727	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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