RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	FPK1	P53739	893 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PAM16	YJL104W	YJR098C	P47139	656 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PAM16	YJL104W	LYS5	P50113	272 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PAM16	YJL104W	TCB1	Q12466	1186 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PAM16	YJL104W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PAM16	YJL104W	DSF2	P38213	736 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAM16	YJL104W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
PAM16	YJL104W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAM16	YJL104W	DLD1	P32891	587 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	YBL086C	P38177	466 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	OSH7	P38755	437 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	JJJ3	P47138	172 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	VAC17	P25591	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	NSG2	P53898	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	HST2	P53686	357 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	CCP1	P00431	361 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	MDJ1	P35191	511 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAM16	YJL104W	APP1	P53933	587 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	MMP1	Q12372	583 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	SCJ1	P25303	377 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	AI1	P03875	834 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	DIT2	P21595	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	THI72	Q08579	599 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM16	YJL104W	MKS1	P34072	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	ESS1	P22696	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	DFG5	Q05031	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	BDS1	Q08347	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	VTC4	P47075	721 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	CEM1	P39525	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	YFL066C	P43538	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	ITT1	Q04638	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	CUZ1	P53899	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAM16	YJL104W	FBP26	P32604	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	ATF2	P53296	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	YJU3	P28321	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	RSC30	P38781	883 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	FIG4	P42837	879 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	STE6	P12866	1290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	ARG8	P18544	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	SKN7	P38889	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	TEC1	P18412	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	DAL1	P32375	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	TDA6	Q06466	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM16	YJL104W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	DIT1	P21623	536 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	UBP15	P50101	1230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	YNR014W	P53719	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	ISU1	Q03020	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	ATG20	Q07528	640 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM16	YJL104W	MSN5	P52918	1224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	GUT2	P32191	649 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	GLC3	P32775	704 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	RAD59	Q12223	238 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	MET1	P36150	593 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	BOI2	P39969	1040 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	CSN12	P47130	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM16	YJL104W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	FPS1	P23900	669 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	SLA1	P32790	1244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	MAC1	P35192	417 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	SSN3	P39073	555 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	WTM2	Q12206	467 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	TAT1	P38085	619 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	FRA1	Q07825	749 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	AIM7	Q12156	149 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	LSB6	P42951	607 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAM16	YJL104W	UTR2	P32623	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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